Protein–RNA interactions for Protein: Q8N5D6

GBGT1, Globoside alpha-1,3-N-acetylgalactosaminyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBGT1Q8N5D6 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
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GBGT1Q8N5D6 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
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GBGT1Q8N5D6 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
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GBGT1Q8N5D6 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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GBGT1Q8N5D6 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
GBGT1Q8N5D6 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
GBGT1Q8N5D6 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
GBGT1Q8N5D6 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
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GBGT1Q8N5D6 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
GBGT1Q8N5D6 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
GBGT1Q8N5D6 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
GBGT1Q8N5D6 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
GBGT1Q8N5D6 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
GBGT1Q8N5D6 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
GBGT1Q8N5D6 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.31
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