Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3S3

PHTF2, Putative homeodomain transcription factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHTF2Q8N3S3 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PHTF2Q8N3S3 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PHTF2Q8N3S3 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PHTF2Q8N3S3 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PHTF2Q8N3S3 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PHTF2Q8N3S3 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PHTF2Q8N3S3 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PHTF2Q8N3S3 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PHTF2Q8N3S3 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PHTF2Q8N3S3 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PHTF2Q8N3S3 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
PHTF2Q8N3S3 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PHTF2Q8N3S3 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC17■□□□□ 0.31
PHTF2Q8N3S3 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PHTF2Q8N3S3 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
PHTF2Q8N3S3 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC17■□□□□ 0.31
PHTF2Q8N3S3 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PHTF2Q8N3S3 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
PHTF2Q8N3S3 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PHTF2Q8N3S3 LINC00511-205ENST00000578206 908 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
PHTF2Q8N3S3 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC17■□□□□ 0.31
PHTF2Q8N3S3 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC17■□□□□ 0.31
PHTF2Q8N3S3 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PHTF2Q8N3S3 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PHTF2Q8N3S3 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PHTF2Q8N3S3 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PHTF2Q8N3S3 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
PHTF2Q8N3S3 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PHTF2Q8N3S3 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PHTF2Q8N3S3 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PHTF2Q8N3S3 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PHTF2Q8N3S3 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PHTF2Q8N3S3 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PHTF2Q8N3S3 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PHTF2Q8N3S3 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PHTF2Q8N3S3 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PHTF2Q8N3S3 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PHTF2Q8N3S3 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PHTF2Q8N3S3 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PHTF2Q8N3S3 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PHTF2Q8N3S3 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PHTF2Q8N3S3 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PHTF2Q8N3S3 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PHTF2Q8N3S3 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PHTF2Q8N3S3 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PHTF2Q8N3S3 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PHTF2Q8N3S3 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PHTF2Q8N3S3 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PHTF2Q8N3S3 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PHTF2Q8N3S3 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PHTF2Q8N3S3 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PHTF2Q8N3S3 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PHTF2Q8N3S3 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PHTF2Q8N3S3 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PHTF2Q8N3S3 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PHTF2Q8N3S3 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PHTF2Q8N3S3 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PHTF2Q8N3S3 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PHTF2Q8N3S3 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PHTF2Q8N3S3 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PHTF2Q8N3S3 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PHTF2Q8N3S3 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PHTF2Q8N3S3 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PHTF2Q8N3S3 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PHTF2Q8N3S3 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PHTF2Q8N3S3 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PHTF2Q8N3S3 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PHTF2Q8N3S3 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PHTF2Q8N3S3 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PHTF2Q8N3S3 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PHTF2Q8N3S3 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PHTF2Q8N3S3 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PHTF2Q8N3S3 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PHTF2Q8N3S3 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PHTF2Q8N3S3 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PHTF2Q8N3S3 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PHTF2Q8N3S3 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PHTF2Q8N3S3 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PHTF2Q8N3S3 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PHTF2Q8N3S3 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PHTF2Q8N3S3 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PHTF2Q8N3S3 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PHTF2Q8N3S3 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PHTF2Q8N3S3 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PHTF2Q8N3S3 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PHTF2Q8N3S3 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PHTF2Q8N3S3 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PHTF2Q8N3S3 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PHTF2Q8N3S3 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PHTF2Q8N3S3 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PHTF2Q8N3S3 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PHTF2Q8N3S3 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PHTF2Q8N3S3 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PHTF2Q8N3S3 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PHTF2Q8N3S3 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PHTF2Q8N3S3 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PHTF2Q8N3S3 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PHTF2Q8N3S3 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PHTF2Q8N3S3 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PHTF2Q8N3S3 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms