Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVB5

LIX1L, LIX1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 337 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIX1LQ8IVB5 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LIX1LQ8IVB5 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LIX1LQ8IVB5 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
LIX1LQ8IVB5 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LIX1LQ8IVB5 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LIX1LQ8IVB5 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LIX1LQ8IVB5 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LIX1LQ8IVB5 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LIX1LQ8IVB5 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LIX1LQ8IVB5 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LIX1LQ8IVB5 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LIX1LQ8IVB5 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LIX1LQ8IVB5 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
LIX1LQ8IVB5 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LIX1LQ8IVB5 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LIX1LQ8IVB5 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LIX1LQ8IVB5 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LIX1LQ8IVB5 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LIX1LQ8IVB5 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LIX1LQ8IVB5 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LIX1LQ8IVB5 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LIX1LQ8IVB5 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LIX1LQ8IVB5 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LIX1LQ8IVB5 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LIX1LQ8IVB5 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LIX1LQ8IVB5 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LIX1LQ8IVB5 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LIX1LQ8IVB5 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LIX1LQ8IVB5 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LIX1LQ8IVB5 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LIX1LQ8IVB5 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LIX1LQ8IVB5 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LIX1LQ8IVB5 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LIX1LQ8IVB5 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LIX1LQ8IVB5 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LIX1LQ8IVB5 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LIX1LQ8IVB5 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
LIX1LQ8IVB5 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LIX1LQ8IVB5 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LIX1LQ8IVB5 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LIX1LQ8IVB5 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LIX1LQ8IVB5 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LIX1LQ8IVB5 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LIX1LQ8IVB5 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
LIX1LQ8IVB5 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
LIX1LQ8IVB5 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
LIX1LQ8IVB5 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LIX1LQ8IVB5 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LIX1LQ8IVB5 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LIX1LQ8IVB5 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LIX1LQ8IVB5 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LIX1LQ8IVB5 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LIX1LQ8IVB5 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LIX1LQ8IVB5 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
LIX1LQ8IVB5 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LIX1LQ8IVB5 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LIX1LQ8IVB5 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LIX1LQ8IVB5 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LIX1LQ8IVB5 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LIX1LQ8IVB5 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LIX1LQ8IVB5 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LIX1LQ8IVB5 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LIX1LQ8IVB5 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LIX1LQ8IVB5 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LIX1LQ8IVB5 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LIX1LQ8IVB5 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LIX1LQ8IVB5 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LIX1LQ8IVB5 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LIX1LQ8IVB5 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LIX1LQ8IVB5 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LIX1LQ8IVB5 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LIX1LQ8IVB5 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LIX1LQ8IVB5 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
LIX1LQ8IVB5 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LIX1LQ8IVB5 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LIX1LQ8IVB5 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LIX1LQ8IVB5 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
LIX1LQ8IVB5 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LIX1LQ8IVB5 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LIX1LQ8IVB5 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LIX1LQ8IVB5 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LIX1LQ8IVB5 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LIX1LQ8IVB5 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LIX1LQ8IVB5 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
LIX1LQ8IVB5 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
LIX1LQ8IVB5 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LIX1LQ8IVB5 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LIX1LQ8IVB5 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LIX1LQ8IVB5 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LIX1LQ8IVB5 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
LIX1LQ8IVB5 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LIX1LQ8IVB5 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LIX1LQ8IVB5 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LIX1LQ8IVB5 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LIX1LQ8IVB5 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LIX1LQ8IVB5 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LIX1LQ8IVB5 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LIX1LQ8IVB5 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LIX1LQ8IVB5 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LIX1LQ8IVB5 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.1 ms