Protein–RNA interactions for Protein: Q86UT8

CCDC84, Coiled-coil domain-containing protein 84, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC84Q86UT8 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC84Q86UT8 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC84Q86UT8 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC84Q86UT8 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC84Q86UT8 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC84Q86UT8 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC84Q86UT8 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC84Q86UT8 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC84Q86UT8 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC84Q86UT8 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC84Q86UT8 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC84Q86UT8 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC84Q86UT8 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC84Q86UT8 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC84Q86UT8 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC84Q86UT8 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC84Q86UT8 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC84Q86UT8 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC84Q86UT8 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC84Q86UT8 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC84Q86UT8 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC84Q86UT8 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC84Q86UT8 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC84Q86UT8 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC84Q86UT8 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC84Q86UT8 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC84Q86UT8 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC84Q86UT8 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC84Q86UT8 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC84Q86UT8 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC84Q86UT8 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC84Q86UT8 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC84Q86UT8 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC84Q86UT8 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC84Q86UT8 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC84Q86UT8 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC84Q86UT8 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC84Q86UT8 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC84Q86UT8 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC84Q86UT8 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC84Q86UT8 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC84Q86UT8 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC84Q86UT8 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC84Q86UT8 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC84Q86UT8 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC84Q86UT8 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC84Q86UT8 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC84Q86UT8 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC84Q86UT8 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC84Q86UT8 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC84Q86UT8 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC84Q86UT8 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC84Q86UT8 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC84Q86UT8 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC84Q86UT8 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC84Q86UT8 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC84Q86UT8 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC84Q86UT8 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC84Q86UT8 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC84Q86UT8 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC84Q86UT8 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC84Q86UT8 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC84Q86UT8 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC84Q86UT8 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC84Q86UT8 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC84Q86UT8 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC84Q86UT8 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC84Q86UT8 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC84Q86UT8 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC84Q86UT8 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC84Q86UT8 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC84Q86UT8 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC84Q86UT8 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC84Q86UT8 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC84Q86UT8 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC84Q86UT8 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC84Q86UT8 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC84Q86UT8 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC84Q86UT8 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC84Q86UT8 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC84Q86UT8 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC84Q86UT8 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC84Q86UT8 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC84Q86UT8 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC84Q86UT8 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC84Q86UT8 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC84Q86UT8 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC84Q86UT8 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC84Q86UT8 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC84Q86UT8 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC84Q86UT8 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC84Q86UT8 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC84Q86UT8 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC84Q86UT8 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC84Q86UT8 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC84Q86UT8 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC84Q86UT8 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC84Q86UT8 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC84Q86UT8 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC84Q86UT8 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms