Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSJ5

LRRC8E, Volume-regulated anion channel subunit LRRC8E, humanhuman

Predictions only

Length 796 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC8EQ6NSJ5 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LRRC8EQ6NSJ5 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LRRC8EQ6NSJ5 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LRRC8EQ6NSJ5 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LRRC8EQ6NSJ5 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LRRC8EQ6NSJ5 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LRRC8EQ6NSJ5 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LRRC8EQ6NSJ5 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LRRC8EQ6NSJ5 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LRRC8EQ6NSJ5 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LRRC8EQ6NSJ5 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LRRC8EQ6NSJ5 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LRRC8EQ6NSJ5 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LRRC8EQ6NSJ5 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LRRC8EQ6NSJ5 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LRRC8EQ6NSJ5 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LRRC8EQ6NSJ5 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LRRC8EQ6NSJ5 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LRRC8EQ6NSJ5 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LRRC8EQ6NSJ5 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LRRC8EQ6NSJ5 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LRRC8EQ6NSJ5 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LRRC8EQ6NSJ5 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LRRC8EQ6NSJ5 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LRRC8EQ6NSJ5 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LRRC8EQ6NSJ5 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LRRC8EQ6NSJ5 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LRRC8EQ6NSJ5 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LRRC8EQ6NSJ5 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LRRC8EQ6NSJ5 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LRRC8EQ6NSJ5 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LRRC8EQ6NSJ5 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LRRC8EQ6NSJ5 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LRRC8EQ6NSJ5 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LRRC8EQ6NSJ5 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LRRC8EQ6NSJ5 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LRRC8EQ6NSJ5 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LRRC8EQ6NSJ5 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LRRC8EQ6NSJ5 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LRRC8EQ6NSJ5 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LRRC8EQ6NSJ5 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LRRC8EQ6NSJ5 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LRRC8EQ6NSJ5 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LRRC8EQ6NSJ5 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LRRC8EQ6NSJ5 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LRRC8EQ6NSJ5 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LRRC8EQ6NSJ5 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LRRC8EQ6NSJ5 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LRRC8EQ6NSJ5 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LRRC8EQ6NSJ5 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LRRC8EQ6NSJ5 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LRRC8EQ6NSJ5 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LRRC8EQ6NSJ5 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
LRRC8EQ6NSJ5 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LRRC8EQ6NSJ5 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LRRC8EQ6NSJ5 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LRRC8EQ6NSJ5 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LRRC8EQ6NSJ5 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LRRC8EQ6NSJ5 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LRRC8EQ6NSJ5 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LRRC8EQ6NSJ5 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LRRC8EQ6NSJ5 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LRRC8EQ6NSJ5 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LRRC8EQ6NSJ5 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LRRC8EQ6NSJ5 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LRRC8EQ6NSJ5 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LRRC8EQ6NSJ5 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LRRC8EQ6NSJ5 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LRRC8EQ6NSJ5 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LRRC8EQ6NSJ5 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
LRRC8EQ6NSJ5 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LRRC8EQ6NSJ5 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LRRC8EQ6NSJ5 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LRRC8EQ6NSJ5 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LRRC8EQ6NSJ5 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LRRC8EQ6NSJ5 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LRRC8EQ6NSJ5 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LRRC8EQ6NSJ5 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LRRC8EQ6NSJ5 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LRRC8EQ6NSJ5 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LRRC8EQ6NSJ5 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LRRC8EQ6NSJ5 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LRRC8EQ6NSJ5 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LRRC8EQ6NSJ5 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LRRC8EQ6NSJ5 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LRRC8EQ6NSJ5 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LRRC8EQ6NSJ5 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LRRC8EQ6NSJ5 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LRRC8EQ6NSJ5 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LRRC8EQ6NSJ5 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LRRC8EQ6NSJ5 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LRRC8EQ6NSJ5 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
LRRC8EQ6NSJ5 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LRRC8EQ6NSJ5 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LRRC8EQ6NSJ5 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LRRC8EQ6NSJ5 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LRRC8EQ6NSJ5 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LRRC8EQ6NSJ5 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LRRC8EQ6NSJ5 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LRRC8EQ6NSJ5 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms