Protein–RNA interactions for Protein: Q6DD88

ATL3, Atlastin-3, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATL3Q6DD88 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATL3Q6DD88 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATL3Q6DD88 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATL3Q6DD88 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATL3Q6DD88 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATL3Q6DD88 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATL3Q6DD88 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATL3Q6DD88 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATL3Q6DD88 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATL3Q6DD88 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATL3Q6DD88 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATL3Q6DD88 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATL3Q6DD88 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATL3Q6DD88 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATL3Q6DD88 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATL3Q6DD88 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATL3Q6DD88 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATL3Q6DD88 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATL3Q6DD88 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATL3Q6DD88 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATL3Q6DD88 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATL3Q6DD88 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATL3Q6DD88 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATL3Q6DD88 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATL3Q6DD88 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATL3Q6DD88 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATL3Q6DD88 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATL3Q6DD88 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATL3Q6DD88 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATL3Q6DD88 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATL3Q6DD88 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATL3Q6DD88 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATL3Q6DD88 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATL3Q6DD88 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATL3Q6DD88 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATL3Q6DD88 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATL3Q6DD88 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
ATL3Q6DD88 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
ATL3Q6DD88 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATL3Q6DD88 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
ATL3Q6DD88 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATL3Q6DD88 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATL3Q6DD88 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
ATL3Q6DD88 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATL3Q6DD88 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATL3Q6DD88 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATL3Q6DD88 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATL3Q6DD88 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATL3Q6DD88 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATL3Q6DD88 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATL3Q6DD88 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATL3Q6DD88 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATL3Q6DD88 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATL3Q6DD88 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATL3Q6DD88 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATL3Q6DD88 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATL3Q6DD88 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATL3Q6DD88 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATL3Q6DD88 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATL3Q6DD88 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATL3Q6DD88 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATL3Q6DD88 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATL3Q6DD88 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATL3Q6DD88 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATL3Q6DD88 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATL3Q6DD88 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATL3Q6DD88 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATL3Q6DD88 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATL3Q6DD88 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
ATL3Q6DD88 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATL3Q6DD88 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATL3Q6DD88 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATL3Q6DD88 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATL3Q6DD88 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATL3Q6DD88 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATL3Q6DD88 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATL3Q6DD88 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATL3Q6DD88 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATL3Q6DD88 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATL3Q6DD88 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATL3Q6DD88 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATL3Q6DD88 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATL3Q6DD88 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATL3Q6DD88 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATL3Q6DD88 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATL3Q6DD88 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATL3Q6DD88 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATL3Q6DD88 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATL3Q6DD88 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATL3Q6DD88 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATL3Q6DD88 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATL3Q6DD88 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATL3Q6DD88 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATL3Q6DD88 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATL3Q6DD88 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATL3Q6DD88 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATL3Q6DD88 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATL3Q6DD88 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATL3Q6DD88 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATL3Q6DD88 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms