Protein–RNA interactions for Protein: Q58FG1

HSP90AA4P, Putative heat shock protein HSP 90-alpha A4, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSP90AA4PQ58FG1 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HSP90AA4PQ58FG1 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HSP90AA4PQ58FG1 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
HSP90AA4PQ58FG1 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HSP90AA4PQ58FG1 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HSP90AA4PQ58FG1 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HSP90AA4PQ58FG1 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HSP90AA4PQ58FG1 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HSP90AA4PQ58FG1 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HSP90AA4PQ58FG1 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HSP90AA4PQ58FG1 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HSP90AA4PQ58FG1 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HSP90AA4PQ58FG1 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HSP90AA4PQ58FG1 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HSP90AA4PQ58FG1 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HSP90AA4PQ58FG1 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HSP90AA4PQ58FG1 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HSP90AA4PQ58FG1 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HSP90AA4PQ58FG1 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HSP90AA4PQ58FG1 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HSP90AA4PQ58FG1 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
HSP90AA4PQ58FG1 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
HSP90AA4PQ58FG1 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HSP90AA4PQ58FG1 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HSP90AA4PQ58FG1 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HSP90AA4PQ58FG1 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HSP90AA4PQ58FG1 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HSP90AA4PQ58FG1 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HSP90AA4PQ58FG1 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HSP90AA4PQ58FG1 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HSP90AA4PQ58FG1 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HSP90AA4PQ58FG1 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HSP90AA4PQ58FG1 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HSP90AA4PQ58FG1 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HSP90AA4PQ58FG1 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HSP90AA4PQ58FG1 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HSP90AA4PQ58FG1 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HSP90AA4PQ58FG1 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HSP90AA4PQ58FG1 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HSP90AA4PQ58FG1 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HSP90AA4PQ58FG1 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HSP90AA4PQ58FG1 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HSP90AA4PQ58FG1 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HSP90AA4PQ58FG1 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HSP90AA4PQ58FG1 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HSP90AA4PQ58FG1 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HSP90AA4PQ58FG1 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HSP90AA4PQ58FG1 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HSP90AA4PQ58FG1 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HSP90AA4PQ58FG1 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HSP90AA4PQ58FG1 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HSP90AA4PQ58FG1 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
HSP90AA4PQ58FG1 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HSP90AA4PQ58FG1 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HSP90AA4PQ58FG1 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HSP90AA4PQ58FG1 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HSP90AA4PQ58FG1 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HSP90AA4PQ58FG1 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HSP90AA4PQ58FG1 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HSP90AA4PQ58FG1 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HSP90AA4PQ58FG1 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HSP90AA4PQ58FG1 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HSP90AA4PQ58FG1 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HSP90AA4PQ58FG1 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HSP90AA4PQ58FG1 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HSP90AA4PQ58FG1 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HSP90AA4PQ58FG1 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HSP90AA4PQ58FG1 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HSP90AA4PQ58FG1 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HSP90AA4PQ58FG1 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HSP90AA4PQ58FG1 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HSP90AA4PQ58FG1 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HSP90AA4PQ58FG1 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
HSP90AA4PQ58FG1 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HSP90AA4PQ58FG1 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HSP90AA4PQ58FG1 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HSP90AA4PQ58FG1 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HSP90AA4PQ58FG1 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HSP90AA4PQ58FG1 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HSP90AA4PQ58FG1 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HSP90AA4PQ58FG1 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HSP90AA4PQ58FG1 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HSP90AA4PQ58FG1 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
HSP90AA4PQ58FG1 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HSP90AA4PQ58FG1 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HSP90AA4PQ58FG1 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
HSP90AA4PQ58FG1 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HSP90AA4PQ58FG1 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HSP90AA4PQ58FG1 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HSP90AA4PQ58FG1 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HSP90AA4PQ58FG1 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HSP90AA4PQ58FG1 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HSP90AA4PQ58FG1 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
HSP90AA4PQ58FG1 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HSP90AA4PQ58FG1 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HSP90AA4PQ58FG1 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HSP90AA4PQ58FG1 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
HSP90AA4PQ58FG1 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HSP90AA4PQ58FG1 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HSP90AA4PQ58FG1 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms