Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZIN3

TMEM259, Membralin, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM259Q4ZIN3 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TMEM259Q4ZIN3 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TMEM259Q4ZIN3 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
TMEM259Q4ZIN3 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TMEM259Q4ZIN3 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TMEM259Q4ZIN3 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TMEM259Q4ZIN3 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TMEM259Q4ZIN3 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TMEM259Q4ZIN3 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TMEM259Q4ZIN3 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TMEM259Q4ZIN3 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TMEM259Q4ZIN3 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TMEM259Q4ZIN3 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TMEM259Q4ZIN3 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TMEM259Q4ZIN3 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TMEM259Q4ZIN3 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TMEM259Q4ZIN3 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TMEM259Q4ZIN3 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TMEM259Q4ZIN3 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TMEM259Q4ZIN3 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TMEM259Q4ZIN3 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
TMEM259Q4ZIN3 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TMEM259Q4ZIN3 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TMEM259Q4ZIN3 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TMEM259Q4ZIN3 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
TMEM259Q4ZIN3 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
TMEM259Q4ZIN3 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TMEM259Q4ZIN3 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
TMEM259Q4ZIN3 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
TMEM259Q4ZIN3 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TMEM259Q4ZIN3 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TMEM259Q4ZIN3 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TMEM259Q4ZIN3 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TMEM259Q4ZIN3 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TMEM259Q4ZIN3 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TMEM259Q4ZIN3 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TMEM259Q4ZIN3 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
TMEM259Q4ZIN3 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TMEM259Q4ZIN3 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TMEM259Q4ZIN3 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TMEM259Q4ZIN3 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TMEM259Q4ZIN3 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TMEM259Q4ZIN3 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TMEM259Q4ZIN3 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TMEM259Q4ZIN3 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TMEM259Q4ZIN3 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TMEM259Q4ZIN3 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TMEM259Q4ZIN3 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TMEM259Q4ZIN3 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TMEM259Q4ZIN3 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TMEM259Q4ZIN3 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TMEM259Q4ZIN3 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TMEM259Q4ZIN3 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TMEM259Q4ZIN3 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TMEM259Q4ZIN3 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TMEM259Q4ZIN3 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TMEM259Q4ZIN3 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TMEM259Q4ZIN3 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TMEM259Q4ZIN3 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TMEM259Q4ZIN3 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TMEM259Q4ZIN3 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TMEM259Q4ZIN3 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TMEM259Q4ZIN3 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
TMEM259Q4ZIN3 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
TMEM259Q4ZIN3 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TMEM259Q4ZIN3 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TMEM259Q4ZIN3 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
TMEM259Q4ZIN3 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TMEM259Q4ZIN3 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TMEM259Q4ZIN3 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
TMEM259Q4ZIN3 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TMEM259Q4ZIN3 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TMEM259Q4ZIN3 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TMEM259Q4ZIN3 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TMEM259Q4ZIN3 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TMEM259Q4ZIN3 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TMEM259Q4ZIN3 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TMEM259Q4ZIN3 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TMEM259Q4ZIN3 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TMEM259Q4ZIN3 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TMEM259Q4ZIN3 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TMEM259Q4ZIN3 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TMEM259Q4ZIN3 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TMEM259Q4ZIN3 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TMEM259Q4ZIN3 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TMEM259Q4ZIN3 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TMEM259Q4ZIN3 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TMEM259Q4ZIN3 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TMEM259Q4ZIN3 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMEM259Q4ZIN3 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMEM259Q4ZIN3 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMEM259Q4ZIN3 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMEM259Q4ZIN3 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMEM259Q4ZIN3 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMEM259Q4ZIN3 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMEM259Q4ZIN3 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMEM259Q4ZIN3 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMEM259Q4ZIN3 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
TMEM259Q4ZIN3 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMEM259Q4ZIN3 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms