Protein–RNA interactions for Protein: Q29983

MICA, MHC class I polypeptide-related sequence A, humanhuman

Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MICAQ29983 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MICAQ29983 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MICAQ29983 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MICAQ29983 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MICAQ29983 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MICAQ29983 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MICAQ29983 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MICAQ29983 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MICAQ29983 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MICAQ29983 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MICAQ29983 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MICAQ29983 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MICAQ29983 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MICAQ29983 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MICAQ29983 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MICAQ29983 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MICAQ29983 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MICAQ29983 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MICAQ29983 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MICAQ29983 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MICAQ29983 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MICAQ29983 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
MICAQ29983 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MICAQ29983 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MICAQ29983 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
MICAQ29983 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MICAQ29983 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MICAQ29983 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MICAQ29983 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MICAQ29983 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
MICAQ29983 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MICAQ29983 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MICAQ29983 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MICAQ29983 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MICAQ29983 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MICAQ29983 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MICAQ29983 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MICAQ29983 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MICAQ29983 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
MICAQ29983 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MICAQ29983 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MICAQ29983 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MICAQ29983 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MICAQ29983 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MICAQ29983 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MICAQ29983 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MICAQ29983 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MICAQ29983 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MICAQ29983 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MICAQ29983 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MICAQ29983 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MICAQ29983 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MICAQ29983 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MICAQ29983 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MICAQ29983 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MICAQ29983 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MICAQ29983 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MICAQ29983 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
MICAQ29983 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MICAQ29983 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MICAQ29983 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MICAQ29983 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MICAQ29983 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MICAQ29983 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MICAQ29983 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MICAQ29983 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MICAQ29983 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MICAQ29983 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MICAQ29983 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MICAQ29983 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MICAQ29983 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MICAQ29983 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MICAQ29983 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MICAQ29983 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MICAQ29983 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MICAQ29983 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MICAQ29983 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MICAQ29983 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MICAQ29983 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MICAQ29983 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MICAQ29983 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MICAQ29983 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MICAQ29983 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MICAQ29983 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MICAQ29983 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MICAQ29983 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MICAQ29983 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MICAQ29983 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MICAQ29983 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MICAQ29983 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MICAQ29983 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MICAQ29983 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MICAQ29983 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MICAQ29983 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MICAQ29983 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MICAQ29983 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MICAQ29983 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MICAQ29983 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MICAQ29983 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MICAQ29983 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms