Protein–RNA interactions for Protein: Q17R60

IMPG1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMPG1Q17R60 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IMPG1Q17R60 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IMPG1Q17R60 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IMPG1Q17R60 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IMPG1Q17R60 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IMPG1Q17R60 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IMPG1Q17R60 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IMPG1Q17R60 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IMPG1Q17R60 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IMPG1Q17R60 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IMPG1Q17R60 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IMPG1Q17R60 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IMPG1Q17R60 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
IMPG1Q17R60 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
IMPG1Q17R60 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
IMPG1Q17R60 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IMPG1Q17R60 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IMPG1Q17R60 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IMPG1Q17R60 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IMPG1Q17R60 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IMPG1Q17R60 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IMPG1Q17R60 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IMPG1Q17R60 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IMPG1Q17R60 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IMPG1Q17R60 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IMPG1Q17R60 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IMPG1Q17R60 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IMPG1Q17R60 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IMPG1Q17R60 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IMPG1Q17R60 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IMPG1Q17R60 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IMPG1Q17R60 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IMPG1Q17R60 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IMPG1Q17R60 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IMPG1Q17R60 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IMPG1Q17R60 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IMPG1Q17R60 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IMPG1Q17R60 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IMPG1Q17R60 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IMPG1Q17R60 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IMPG1Q17R60 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IMPG1Q17R60 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IMPG1Q17R60 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IMPG1Q17R60 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IMPG1Q17R60 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IMPG1Q17R60 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IMPG1Q17R60 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IMPG1Q17R60 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IMPG1Q17R60 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IMPG1Q17R60 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IMPG1Q17R60 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IMPG1Q17R60 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IMPG1Q17R60 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
IMPG1Q17R60 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
IMPG1Q17R60 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IMPG1Q17R60 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
IMPG1Q17R60 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
IMPG1Q17R60 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IMPG1Q17R60 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IMPG1Q17R60 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
IMPG1Q17R60 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IMPG1Q17R60 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IMPG1Q17R60 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IMPG1Q17R60 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IMPG1Q17R60 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IMPG1Q17R60 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IMPG1Q17R60 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
IMPG1Q17R60 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IMPG1Q17R60 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IMPG1Q17R60 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IMPG1Q17R60 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IMPG1Q17R60 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IMPG1Q17R60 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IMPG1Q17R60 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IMPG1Q17R60 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IMPG1Q17R60 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IMPG1Q17R60 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IMPG1Q17R60 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IMPG1Q17R60 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IMPG1Q17R60 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IMPG1Q17R60 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IMPG1Q17R60 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IMPG1Q17R60 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IMPG1Q17R60 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IMPG1Q17R60 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IMPG1Q17R60 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IMPG1Q17R60 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IMPG1Q17R60 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IMPG1Q17R60 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IMPG1Q17R60 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IMPG1Q17R60 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IMPG1Q17R60 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IMPG1Q17R60 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IMPG1Q17R60 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IMPG1Q17R60 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IMPG1Q17R60 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IMPG1Q17R60 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IMPG1Q17R60 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
IMPG1Q17R60 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IMPG1Q17R60 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms