Protein–RNA interactions for Protein: Q16795

NDUFA9, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 9, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFA9Q16795 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NDUFA9Q16795 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NDUFA9Q16795 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NDUFA9Q16795 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NDUFA9Q16795 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NDUFA9Q16795 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NDUFA9Q16795 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NDUFA9Q16795 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NDUFA9Q16795 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NDUFA9Q16795 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NDUFA9Q16795 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NDUFA9Q16795 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NDUFA9Q16795 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NDUFA9Q16795 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NDUFA9Q16795 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NDUFA9Q16795 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
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NDUFA9Q16795 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NDUFA9Q16795 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NDUFA9Q16795 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NDUFA9Q16795 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NDUFA9Q16795 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NDUFA9Q16795 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NDUFA9Q16795 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
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NDUFA9Q16795 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NDUFA9Q16795 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NDUFA9Q16795 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NDUFA9Q16795 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NDUFA9Q16795 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NDUFA9Q16795 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
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NDUFA9Q16795 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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NDUFA9Q16795 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NDUFA9Q16795 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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NDUFA9Q16795 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NDUFA9Q16795 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NDUFA9Q16795 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NDUFA9Q16795 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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NDUFA9Q16795 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NDUFA9Q16795 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
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NDUFA9Q16795 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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NDUFA9Q16795 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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NDUFA9Q16795 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NDUFA9Q16795 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NDUFA9Q16795 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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NDUFA9Q16795 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NDUFA9Q16795 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
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NDUFA9Q16795 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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NDUFA9Q16795 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NDUFA9Q16795 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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NDUFA9Q16795 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NDUFA9Q16795 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NDUFA9Q16795 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
NDUFA9Q16795 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
NDUFA9Q16795 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
NDUFA9Q16795 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NDUFA9Q16795 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
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NDUFA9Q16795 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NDUFA9Q16795 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
NDUFA9Q16795 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NDUFA9Q16795 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NDUFA9Q16795 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NDUFA9Q16795 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NDUFA9Q16795 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NDUFA9Q16795 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NDUFA9Q16795 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NDUFA9Q16795 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NDUFA9Q16795 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NDUFA9Q16795 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NDUFA9Q16795 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NDUFA9Q16795 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NDUFA9Q16795 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NDUFA9Q16795 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NDUFA9Q16795 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
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