Protein–RNA interactions for Protein: Q16619

CTF1, Cardiotrophin-1, humanhuman

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Length 201 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTF1Q16619 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CTF1Q16619 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CTF1Q16619 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CTF1Q16619 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CTF1Q16619 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CTF1Q16619 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CTF1Q16619 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CTF1Q16619 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CTF1Q16619 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CTF1Q16619 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CTF1Q16619 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CTF1Q16619 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CTF1Q16619 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CTF1Q16619 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CTF1Q16619 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CTF1Q16619 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CTF1Q16619 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CTF1Q16619 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CTF1Q16619 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CTF1Q16619 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CTF1Q16619 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CTF1Q16619 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CTF1Q16619 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CTF1Q16619 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CTF1Q16619 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CTF1Q16619 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CTF1Q16619 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CTF1Q16619 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CTF1Q16619 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CTF1Q16619 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CTF1Q16619 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CTF1Q16619 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CTF1Q16619 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CTF1Q16619 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CTF1Q16619 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CTF1Q16619 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CTF1Q16619 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CTF1Q16619 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CTF1Q16619 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
CTF1Q16619 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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CTF1Q16619 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CTF1Q16619 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CTF1Q16619 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CTF1Q16619 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CTF1Q16619 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CTF1Q16619 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CTF1Q16619 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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CTF1Q16619 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CTF1Q16619 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CTF1Q16619 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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CTF1Q16619 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CTF1Q16619 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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CTF1Q16619 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CTF1Q16619 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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CTF1Q16619 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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CTF1Q16619 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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CTF1Q16619 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CTF1Q16619 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CTF1Q16619 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
CTF1Q16619 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CTF1Q16619 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CTF1Q16619 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CTF1Q16619 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CTF1Q16619 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CTF1Q16619 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CTF1Q16619 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CTF1Q16619 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CTF1Q16619 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CTF1Q16619 AC010247.2-201ENST00000559786 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CTF1Q16619 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CTF1Q16619 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
CTF1Q16619 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CTF1Q16619 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CTF1Q16619 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CTF1Q16619 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
CTF1Q16619 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CTF1Q16619 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
CTF1Q16619 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CTF1Q16619 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CTF1Q16619 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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