Protein–RNA interactions for Protein: Q16585

SGCB, Beta-sarcoglycan, humanhuman

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Length 318 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCBQ16585 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SGCBQ16585 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SGCBQ16585 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SGCBQ16585 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
SGCBQ16585 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SGCBQ16585 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SGCBQ16585 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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SGCBQ16585 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
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SGCBQ16585 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SGCBQ16585 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
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SGCBQ16585 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SGCBQ16585 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
SGCBQ16585 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SGCBQ16585 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SGCBQ16585 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SGCBQ16585 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SGCBQ16585 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
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SGCBQ16585 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SGCBQ16585 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SGCBQ16585 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SGCBQ16585 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SGCBQ16585 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
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SGCBQ16585 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SGCBQ16585 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
SGCBQ16585 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SGCBQ16585 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
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SGCBQ16585 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC15.02■□□□□ -0
SGCBQ16585 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
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SGCBQ16585 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
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SGCBQ16585 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
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SGCBQ16585 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
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SGCBQ16585 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
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SGCBQ16585 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
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SGCBQ16585 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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SGCBQ16585 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SGCBQ16585 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
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SGCBQ16585 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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SGCBQ16585 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
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SGCBQ16585 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
SGCBQ16585 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SGCBQ16585 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SGCBQ16585 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SGCBQ16585 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SGCBQ16585 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SGCBQ16585 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SGCBQ16585 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
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