Protein–RNA interactions for Protein: Q14264

ERV3-1, Endogenous retrovirus group 3 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERV3-1Q14264 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ERV3-1Q14264 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ERV3-1Q14264 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ERV3-1Q14264 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ERV3-1Q14264 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ERV3-1Q14264 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ERV3-1Q14264 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ERV3-1Q14264 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ERV3-1Q14264 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ERV3-1Q14264 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ERV3-1Q14264 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ERV3-1Q14264 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ERV3-1Q14264 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ERV3-1Q14264 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ERV3-1Q14264 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ERV3-1Q14264 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ERV3-1Q14264 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ERV3-1Q14264 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ERV3-1Q14264 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ERV3-1Q14264 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
ERV3-1Q14264 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
ERV3-1Q14264 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
ERV3-1Q14264 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ERV3-1Q14264 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ERV3-1Q14264 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ERV3-1Q14264 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ERV3-1Q14264 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ERV3-1Q14264 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
ERV3-1Q14264 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
ERV3-1Q14264 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ERV3-1Q14264 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ERV3-1Q14264 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ERV3-1Q14264 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ERV3-1Q14264 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ERV3-1Q14264 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ERV3-1Q14264 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ERV3-1Q14264 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ERV3-1Q14264 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ERV3-1Q14264 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ERV3-1Q14264 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ERV3-1Q14264 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ERV3-1Q14264 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ERV3-1Q14264 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ERV3-1Q14264 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ERV3-1Q14264 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ERV3-1Q14264 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ERV3-1Q14264 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ERV3-1Q14264 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ERV3-1Q14264 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ERV3-1Q14264 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ERV3-1Q14264 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ERV3-1Q14264 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ERV3-1Q14264 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ERV3-1Q14264 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ERV3-1Q14264 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ERV3-1Q14264 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ERV3-1Q14264 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ERV3-1Q14264 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ERV3-1Q14264 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ERV3-1Q14264 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ERV3-1Q14264 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ERV3-1Q14264 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ERV3-1Q14264 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ERV3-1Q14264 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ERV3-1Q14264 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ERV3-1Q14264 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ERV3-1Q14264 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ERV3-1Q14264 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ERV3-1Q14264 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ERV3-1Q14264 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ERV3-1Q14264 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ERV3-1Q14264 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ERV3-1Q14264 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ERV3-1Q14264 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ERV3-1Q14264 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ERV3-1Q14264 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ERV3-1Q14264 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ERV3-1Q14264 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ERV3-1Q14264 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ERV3-1Q14264 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ERV3-1Q14264 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ERV3-1Q14264 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ERV3-1Q14264 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ERV3-1Q14264 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ERV3-1Q14264 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ERV3-1Q14264 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ERV3-1Q14264 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ERV3-1Q14264 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ERV3-1Q14264 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ERV3-1Q14264 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ERV3-1Q14264 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ERV3-1Q14264 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ERV3-1Q14264 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ERV3-1Q14264 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ERV3-1Q14264 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ERV3-1Q14264 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ERV3-1Q14264 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ERV3-1Q14264 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ERV3-1Q14264 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ERV3-1Q14264 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms