Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

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Length 583 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ALCAMQ13740 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ALCAMQ13740 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ALCAMQ13740 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ALCAMQ13740 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ALCAMQ13740 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ALCAMQ13740 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ALCAMQ13740 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ALCAMQ13740 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ALCAMQ13740 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ALCAMQ13740 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ALCAMQ13740 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ALCAMQ13740 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ALCAMQ13740 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ALCAMQ13740 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ALCAMQ13740 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ALCAMQ13740 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ALCAMQ13740 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ALCAMQ13740 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ALCAMQ13740 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ALCAMQ13740 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ALCAMQ13740 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ALCAMQ13740 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
ALCAMQ13740 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
ALCAMQ13740 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ALCAMQ13740 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ALCAMQ13740 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
ALCAMQ13740 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
ALCAMQ13740 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ALCAMQ13740 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ALCAMQ13740 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ALCAMQ13740 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ALCAMQ13740 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ALCAMQ13740 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ALCAMQ13740 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ALCAMQ13740 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ALCAMQ13740 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ALCAMQ13740 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ALCAMQ13740 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ALCAMQ13740 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ALCAMQ13740 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ALCAMQ13740 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
ALCAMQ13740 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ALCAMQ13740 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ALCAMQ13740 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ALCAMQ13740 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
ALCAMQ13740 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ALCAMQ13740 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ALCAMQ13740 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ALCAMQ13740 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ALCAMQ13740 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ALCAMQ13740 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ALCAMQ13740 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ALCAMQ13740 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ALCAMQ13740 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ALCAMQ13740 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ALCAMQ13740 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ALCAMQ13740 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ALCAMQ13740 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ALCAMQ13740 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ALCAMQ13740 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ALCAMQ13740 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ALCAMQ13740 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ALCAMQ13740 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
ALCAMQ13740 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ALCAMQ13740 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
ALCAMQ13740 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
ALCAMQ13740 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ALCAMQ13740 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
ALCAMQ13740 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ALCAMQ13740 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ALCAMQ13740 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ALCAMQ13740 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ALCAMQ13740 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ALCAMQ13740 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ALCAMQ13740 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ALCAMQ13740 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ALCAMQ13740 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ALCAMQ13740 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ALCAMQ13740 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
ALCAMQ13740 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
ALCAMQ13740 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ALCAMQ13740 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ALCAMQ13740 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ALCAMQ13740 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ALCAMQ13740 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ALCAMQ13740 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ALCAMQ13740 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ALCAMQ13740 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ALCAMQ13740 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ALCAMQ13740 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ALCAMQ13740 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ALCAMQ13740 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ALCAMQ13740 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ALCAMQ13740 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ALCAMQ13740 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ALCAMQ13740 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ALCAMQ13740 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ALCAMQ13740 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ALCAMQ13740 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
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