Protein–RNA interactions for Protein: Q13683

ITGA7, Integrin alpha-7, humanhuman

Predictions only

Length 1,181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA7Q13683 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ITGA7Q13683 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ITGA7Q13683 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ITGA7Q13683 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ITGA7Q13683 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ITGA7Q13683 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ITGA7Q13683 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ITGA7Q13683 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ITGA7Q13683 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ITGA7Q13683 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ITGA7Q13683 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ITGA7Q13683 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ITGA7Q13683 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ITGA7Q13683 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ITGA7Q13683 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ITGA7Q13683 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ITGA7Q13683 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ITGA7Q13683 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ITGA7Q13683 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ITGA7Q13683 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ITGA7Q13683 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ITGA7Q13683 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ITGA7Q13683 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ITGA7Q13683 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ITGA7Q13683 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
ITGA7Q13683 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ITGA7Q13683 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ITGA7Q13683 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ITGA7Q13683 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ITGA7Q13683 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ITGA7Q13683 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ITGA7Q13683 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ITGA7Q13683 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ITGA7Q13683 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ITGA7Q13683 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ITGA7Q13683 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ITGA7Q13683 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ITGA7Q13683 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ITGA7Q13683 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ITGA7Q13683 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ITGA7Q13683 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ITGA7Q13683 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ITGA7Q13683 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ITGA7Q13683 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ITGA7Q13683 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ITGA7Q13683 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ITGA7Q13683 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ITGA7Q13683 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ITGA7Q13683 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ITGA7Q13683 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ITGA7Q13683 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ITGA7Q13683 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ITGA7Q13683 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ITGA7Q13683 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGA7Q13683 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGA7Q13683 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGA7Q13683 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGA7Q13683 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGA7Q13683 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGA7Q13683 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGA7Q13683 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGA7Q13683 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGA7Q13683 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGA7Q13683 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGA7Q13683 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGA7Q13683 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGA7Q13683 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGA7Q13683 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGA7Q13683 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGA7Q13683 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGA7Q13683 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGA7Q13683 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGA7Q13683 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGA7Q13683 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGA7Q13683 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGA7Q13683 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGA7Q13683 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGA7Q13683 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGA7Q13683 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGA7Q13683 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGA7Q13683 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGA7Q13683 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGA7Q13683 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGA7Q13683 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGA7Q13683 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGA7Q13683 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGA7Q13683 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGA7Q13683 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGA7Q13683 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGA7Q13683 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGA7Q13683 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGA7Q13683 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGA7Q13683 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ITGA7Q13683 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ITGA7Q13683 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ITGA7Q13683 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ITGA7Q13683 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ITGA7Q13683 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ITGA7Q13683 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ITGA7Q13683 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms