Protein–RNA interactions for Protein: Q13643

FHL3, Four and a half LIM domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FHL3Q13643 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC12.57□□□□□ -0.4
FHL3Q13643 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
FHL3Q13643 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
FHL3Q13643 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC12.57□□□□□ -0.4
FHL3Q13643 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC12.57□□□□□ -0.4
FHL3Q13643 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
FHL3Q13643 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
FHL3Q13643 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
FHL3Q13643 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
FHL3Q13643 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
FHL3Q13643 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
FHL3Q13643 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
FHL3Q13643 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
FHL3Q13643 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
FHL3Q13643 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
FHL3Q13643 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
FHL3Q13643 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
FHL3Q13643 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
FHL3Q13643 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
FHL3Q13643 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
FHL3Q13643 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
FHL3Q13643 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
FHL3Q13643 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
FHL3Q13643 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
FHL3Q13643 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
FHL3Q13643 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
FHL3Q13643 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
FHL3Q13643 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
FHL3Q13643 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
FHL3Q13643 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
FHL3Q13643 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
FHL3Q13643 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
FHL3Q13643 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
FHL3Q13643 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
FHL3Q13643 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
FHL3Q13643 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
FHL3Q13643 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
FHL3Q13643 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC12.56□□□□□ -0.4
FHL3Q13643 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
FHL3Q13643 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
FHL3Q13643 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
FHL3Q13643 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
FHL3Q13643 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
FHL3Q13643 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC12.56□□□□□ -0.4
FHL3Q13643 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
FHL3Q13643 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
FHL3Q13643 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC12.56□□□□□ -0.4
FHL3Q13643 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
FHL3Q13643 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC12.56□□□□□ -0.4
FHL3Q13643 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
FHL3Q13643 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC12.56□□□□□ -0.4
FHL3Q13643 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC12.56□□□□□ -0.4
FHL3Q13643 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
FHL3Q13643 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
FHL3Q13643 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
FHL3Q13643 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
FHL3Q13643 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
FHL3Q13643 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
FHL3Q13643 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
FHL3Q13643 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
FHL3Q13643 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
FHL3Q13643 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
FHL3Q13643 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
FHL3Q13643 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC12.56□□□□□ -0.4
FHL3Q13643 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC12.56□□□□□ -0.4
FHL3Q13643 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
FHL3Q13643 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
FHL3Q13643 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC12.56□□□□□ -0.4
FHL3Q13643 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
FHL3Q13643 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
FHL3Q13643 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
FHL3Q13643 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
FHL3Q13643 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
FHL3Q13643 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
FHL3Q13643 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
FHL3Q13643 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
FHL3Q13643 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
FHL3Q13643 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
FHL3Q13643 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC12.55□□□□□ -0.4
FHL3Q13643 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
FHL3Q13643 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
FHL3Q13643 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
FHL3Q13643 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
FHL3Q13643 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
FHL3Q13643 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
FHL3Q13643 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
FHL3Q13643 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
FHL3Q13643 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
FHL3Q13643 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
FHL3Q13643 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
FHL3Q13643 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
FHL3Q13643 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC12.55□□□□□ -0.4
FHL3Q13643 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
FHL3Q13643 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
FHL3Q13643 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
FHL3Q13643 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
FHL3Q13643 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
FHL3Q13643 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
FHL3Q13643 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
FHL3Q13643 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms