Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

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Length 1,447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTCH1Q13635 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTCH1Q13635 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTCH1Q13635 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTCH1Q13635 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTCH1Q13635 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTCH1Q13635 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTCH1Q13635 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTCH1Q13635 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTCH1Q13635 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTCH1Q13635 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PTCH1Q13635 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTCH1Q13635 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTCH1Q13635 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTCH1Q13635 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTCH1Q13635 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PTCH1Q13635 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTCH1Q13635 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTCH1Q13635 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PTCH1Q13635 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTCH1Q13635 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTCH1Q13635 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTCH1Q13635 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTCH1Q13635 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PTCH1Q13635 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTCH1Q13635 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTCH1Q13635 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTCH1Q13635 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTCH1Q13635 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTCH1Q13635 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTCH1Q13635 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTCH1Q13635 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTCH1Q13635 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTCH1Q13635 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTCH1Q13635 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTCH1Q13635 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTCH1Q13635 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTCH1Q13635 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTCH1Q13635 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTCH1Q13635 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTCH1Q13635 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTCH1Q13635 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTCH1Q13635 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTCH1Q13635 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTCH1Q13635 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTCH1Q13635 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTCH1Q13635 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTCH1Q13635 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTCH1Q13635 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTCH1Q13635 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTCH1Q13635 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTCH1Q13635 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTCH1Q13635 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PTCH1Q13635 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PTCH1Q13635 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTCH1Q13635 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PTCH1Q13635 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PTCH1Q13635 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTCH1Q13635 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTCH1Q13635 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTCH1Q13635 RETN-203ENST00000629642 400 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTCH1Q13635 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTCH1Q13635 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTCH1Q13635 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTCH1Q13635 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTCH1Q13635 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PTCH1Q13635 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PTCH1Q13635 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTCH1Q13635 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTCH1Q13635 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTCH1Q13635 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTCH1Q13635 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTCH1Q13635 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTCH1Q13635 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTCH1Q13635 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTCH1Q13635 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTCH1Q13635 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTCH1Q13635 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTCH1Q13635 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PTCH1Q13635 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTCH1Q13635 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTCH1Q13635 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTCH1Q13635 RCAN1-212ENST00000492600 935 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTCH1Q13635 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTCH1Q13635 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTCH1Q13635 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PTCH1Q13635 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PTCH1Q13635 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTCH1Q13635 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTCH1Q13635 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTCH1Q13635 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTCH1Q13635 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTCH1Q13635 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTCH1Q13635 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTCH1Q13635 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTCH1Q13635 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTCH1Q13635 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTCH1Q13635 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PTCH1Q13635 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTCH1Q13635 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
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