Protein–RNA interactions for Protein: Q13367

AP3B2, AP-3 complex subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,082 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3B2Q13367 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
AP3B2Q13367 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
AP3B2Q13367 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
AP3B2Q13367 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
AP3B2Q13367 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
AP3B2Q13367 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
AP3B2Q13367 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
AP3B2Q13367 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
AP3B2Q13367 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
AP3B2Q13367 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
AP3B2Q13367 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
AP3B2Q13367 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
AP3B2Q13367 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
AP3B2Q13367 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
AP3B2Q13367 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
AP3B2Q13367 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
AP3B2Q13367 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
AP3B2Q13367 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
AP3B2Q13367 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
AP3B2Q13367 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
AP3B2Q13367 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
AP3B2Q13367 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
AP3B2Q13367 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
AP3B2Q13367 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
AP3B2Q13367 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
AP3B2Q13367 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
AP3B2Q13367 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
AP3B2Q13367 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
AP3B2Q13367 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
AP3B2Q13367 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
AP3B2Q13367 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
AP3B2Q13367 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
AP3B2Q13367 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
AP3B2Q13367 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
AP3B2Q13367 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
AP3B2Q13367 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
AP3B2Q13367 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
AP3B2Q13367 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
AP3B2Q13367 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
AP3B2Q13367 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
AP3B2Q13367 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
AP3B2Q13367 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
AP3B2Q13367 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
AP3B2Q13367 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
AP3B2Q13367 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
AP3B2Q13367 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
AP3B2Q13367 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
AP3B2Q13367 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
AP3B2Q13367 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
AP3B2Q13367 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
AP3B2Q13367 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
AP3B2Q13367 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
AP3B2Q13367 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
AP3B2Q13367 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
AP3B2Q13367 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
AP3B2Q13367 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
AP3B2Q13367 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
AP3B2Q13367 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
AP3B2Q13367 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
AP3B2Q13367 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
AP3B2Q13367 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
AP3B2Q13367 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
AP3B2Q13367 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
AP3B2Q13367 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
AP3B2Q13367 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
AP3B2Q13367 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
AP3B2Q13367 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
AP3B2Q13367 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
AP3B2Q13367 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
AP3B2Q13367 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
AP3B2Q13367 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
AP3B2Q13367 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
AP3B2Q13367 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
AP3B2Q13367 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
AP3B2Q13367 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
AP3B2Q13367 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
AP3B2Q13367 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
AP3B2Q13367 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
AP3B2Q13367 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
AP3B2Q13367 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
AP3B2Q13367 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
AP3B2Q13367 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
AP3B2Q13367 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
AP3B2Q13367 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
AP3B2Q13367 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
AP3B2Q13367 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
AP3B2Q13367 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
AP3B2Q13367 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
AP3B2Q13367 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
AP3B2Q13367 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
AP3B2Q13367 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
AP3B2Q13367 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
AP3B2Q13367 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
AP3B2Q13367 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
AP3B2Q13367 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
AP3B2Q13367 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
AP3B2Q13367 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
AP3B2Q13367 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
AP3B2Q13367 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
AP3B2Q13367 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
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