Protein–RNA interactions for Protein: Q13185

CBX3, Chromobox protein homolog 3, humanhuman

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX3Q13185 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CBX3Q13185 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CBX3Q13185 TUBGCP6-201ENST00000248846 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CBX3Q13185 KIAA0895L-201ENST00000290881 3550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CBX3Q13185 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CBX3Q13185 UBA5-202ENST00000356232 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CBX3Q13185 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CBX3Q13185 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CBX3Q13185 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CBX3Q13185 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CBX3Q13185 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CBX3Q13185 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CBX3Q13185 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CBX3Q13185 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CBX3Q13185 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CBX3Q13185 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CBX3Q13185 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CBX3Q13185 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
CBX3Q13185 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CBX3Q13185 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CBX3Q13185 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CBX3Q13185 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CBX3Q13185 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CBX3Q13185 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CBX3Q13185 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CBX3Q13185 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CBX3Q13185 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CBX3Q13185 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CBX3Q13185 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CBX3Q13185 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CBX3Q13185 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CBX3Q13185 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CBX3Q13185 LIMS1-215ENST00000544547 4461 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CBX3Q13185 RUNX3-203ENST00000399916 4340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CBX3Q13185 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CBX3Q13185 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CBX3Q13185 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CBX3Q13185 LIG1-203ENST00000536218 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CBX3Q13185 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CBX3Q13185 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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CBX3Q13185 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CBX3Q13185 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
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CBX3Q13185 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CBX3Q13185 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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CBX3Q13185 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CBX3Q13185 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CBX3Q13185 FBN3-205ENST00000600128 9362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CBX3Q13185 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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CBX3Q13185 RASGEF1A-202ENST00000374459 3264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CBX3Q13185 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CBX3Q13185 AC005562.1-201ENST00000583030 3219 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
CBX3Q13185 SERPINA4-203ENST00000557004 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CBX3Q13185 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CBX3Q13185 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CBX3Q13185 AC113189.2-201ENST00000575310 1975 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CBX3Q13185 STRA6-202ENST00000395105 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CBX3Q13185 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CBX3Q13185 MINDY1-207ENST00000622754 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CBX3Q13185 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CBX3Q13185 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CBX3Q13185 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CBX3Q13185 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CBX3Q13185 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CBX3Q13185 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CBX3Q13185 NDRG4-255ENST00000570248 3207 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CBX3Q13185 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CBX3Q13185 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
CBX3Q13185 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
CBX3Q13185 XKRX-202ENST00000468904 2249 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
CBX3Q13185 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CBX3Q13185 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
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