Protein–RNA interactions for Protein: Q13098

GPS1, COP9 signalosome complex subunit 1, humanhuman

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPS1Q13098 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GPS1Q13098 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GPS1Q13098 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GPS1Q13098 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GPS1Q13098 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GPS1Q13098 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GPS1Q13098 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GPS1Q13098 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GPS1Q13098 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GPS1Q13098 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GPS1Q13098 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
GPS1Q13098 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GPS1Q13098 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GPS1Q13098 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GPS1Q13098 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GPS1Q13098 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GPS1Q13098 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GPS1Q13098 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
GPS1Q13098 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GPS1Q13098 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GPS1Q13098 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
GPS1Q13098 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
GPS1Q13098 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GPS1Q13098 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GPS1Q13098 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GPS1Q13098 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GPS1Q13098 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GPS1Q13098 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GPS1Q13098 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GPS1Q13098 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GPS1Q13098 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GPS1Q13098 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GPS1Q13098 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GPS1Q13098 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GPS1Q13098 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GPS1Q13098 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GPS1Q13098 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GPS1Q13098 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GPS1Q13098 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GPS1Q13098 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GPS1Q13098 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GPS1Q13098 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GPS1Q13098 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GPS1Q13098 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GPS1Q13098 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GPS1Q13098 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GPS1Q13098 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GPS1Q13098 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GPS1Q13098 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GPS1Q13098 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GPS1Q13098 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GPS1Q13098 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GPS1Q13098 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GPS1Q13098 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GPS1Q13098 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GPS1Q13098 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GPS1Q13098 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GPS1Q13098 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GPS1Q13098 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
GPS1Q13098 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
GPS1Q13098 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GPS1Q13098 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GPS1Q13098 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GPS1Q13098 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
GPS1Q13098 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
GPS1Q13098 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GPS1Q13098 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
GPS1Q13098 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GPS1Q13098 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GPS1Q13098 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GPS1Q13098 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GPS1Q13098 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GPS1Q13098 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GPS1Q13098 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GPS1Q13098 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GPS1Q13098 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GPS1Q13098 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GPS1Q13098 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GPS1Q13098 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GPS1Q13098 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
GPS1Q13098 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GPS1Q13098 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GPS1Q13098 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GPS1Q13098 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GPS1Q13098 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GPS1Q13098 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GPS1Q13098 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GPS1Q13098 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GPS1Q13098 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GPS1Q13098 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GPS1Q13098 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GPS1Q13098 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GPS1Q13098 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GPS1Q13098 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
GPS1Q13098 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GPS1Q13098 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GPS1Q13098 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GPS1Q13098 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GPS1Q13098 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
GPS1Q13098 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
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