Protein–RNA interactions for Protein: Q12980

NPRL3, GATOR complex protein NPRL3, humanhuman

Predictions only

Length 569 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPRL3Q12980 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NPRL3Q12980 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NPRL3Q12980 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NPRL3Q12980 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NPRL3Q12980 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NPRL3Q12980 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NPRL3Q12980 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
NPRL3Q12980 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NPRL3Q12980 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NPRL3Q12980 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NPRL3Q12980 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NPRL3Q12980 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NPRL3Q12980 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NPRL3Q12980 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NPRL3Q12980 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NPRL3Q12980 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
NPRL3Q12980 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NPRL3Q12980 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NPRL3Q12980 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NPRL3Q12980 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NPRL3Q12980 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NPRL3Q12980 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NPRL3Q12980 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NPRL3Q12980 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NPRL3Q12980 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NPRL3Q12980 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NPRL3Q12980 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
NPRL3Q12980 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NPRL3Q12980 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
NPRL3Q12980 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NPRL3Q12980 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NPRL3Q12980 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NPRL3Q12980 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NPRL3Q12980 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NPRL3Q12980 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NPRL3Q12980 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NPRL3Q12980 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NPRL3Q12980 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
NPRL3Q12980 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NPRL3Q12980 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
NPRL3Q12980 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NPRL3Q12980 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
NPRL3Q12980 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NPRL3Q12980 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NPRL3Q12980 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NPRL3Q12980 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NPRL3Q12980 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NPRL3Q12980 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NPRL3Q12980 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
NPRL3Q12980 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NPRL3Q12980 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NPRL3Q12980 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
NPRL3Q12980 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NPRL3Q12980 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
NPRL3Q12980 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NPRL3Q12980 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NPRL3Q12980 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NPRL3Q12980 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NPRL3Q12980 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NPRL3Q12980 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NPRL3Q12980 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NPRL3Q12980 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NPRL3Q12980 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NPRL3Q12980 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NPRL3Q12980 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NPRL3Q12980 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NPRL3Q12980 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NPRL3Q12980 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
NPRL3Q12980 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NPRL3Q12980 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
NPRL3Q12980 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NPRL3Q12980 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NPRL3Q12980 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NPRL3Q12980 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NPRL3Q12980 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NPRL3Q12980 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NPRL3Q12980 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NPRL3Q12980 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NPRL3Q12980 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NPRL3Q12980 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NPRL3Q12980 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NPRL3Q12980 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NPRL3Q12980 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
NPRL3Q12980 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NPRL3Q12980 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NPRL3Q12980 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
NPRL3Q12980 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NPRL3Q12980 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NPRL3Q12980 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NPRL3Q12980 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NPRL3Q12980 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
NPRL3Q12980 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NPRL3Q12980 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NPRL3Q12980 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
NPRL3Q12980 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NPRL3Q12980 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NPRL3Q12980 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NPRL3Q12980 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
NPRL3Q12980 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
NPRL3Q12980 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms