Protein–RNA interactions for Protein: Q12951

FOXI1, Forkhead box protein I1, humanhuman

Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXI1Q12951 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
FOXI1Q12951 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
FOXI1Q12951 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
FOXI1Q12951 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
FOXI1Q12951 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
FOXI1Q12951 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
FOXI1Q12951 IFRD1-205ENST00000429071 1938 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
FOXI1Q12951 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
FOXI1Q12951 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
FOXI1Q12951 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
FOXI1Q12951 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
FOXI1Q12951 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
FOXI1Q12951 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
FOXI1Q12951 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
FOXI1Q12951 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
FOXI1Q12951 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
FOXI1Q12951 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
FOXI1Q12951 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
FOXI1Q12951 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
FOXI1Q12951 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
FOXI1Q12951 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
FOXI1Q12951 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
FOXI1Q12951 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
FOXI1Q12951 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
FOXI1Q12951 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
FOXI1Q12951 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
FOXI1Q12951 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
FOXI1Q12951 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
FOXI1Q12951 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
FOXI1Q12951 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
FOXI1Q12951 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
FOXI1Q12951 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
FOXI1Q12951 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
FOXI1Q12951 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
FOXI1Q12951 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
FOXI1Q12951 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
FOXI1Q12951 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
FOXI1Q12951 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
FOXI1Q12951 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
FOXI1Q12951 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
FOXI1Q12951 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
FOXI1Q12951 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
FOXI1Q12951 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
FOXI1Q12951 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
FOXI1Q12951 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
FOXI1Q12951 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
FOXI1Q12951 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
FOXI1Q12951 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
FOXI1Q12951 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
FOXI1Q12951 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
FOXI1Q12951 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
FOXI1Q12951 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
FOXI1Q12951 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
FOXI1Q12951 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
FOXI1Q12951 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
FOXI1Q12951 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
FOXI1Q12951 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
FOXI1Q12951 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
FOXI1Q12951 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
FOXI1Q12951 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
FOXI1Q12951 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
FOXI1Q12951 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
FOXI1Q12951 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
FOXI1Q12951 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
FOXI1Q12951 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
FOXI1Q12951 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
FOXI1Q12951 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
FOXI1Q12951 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
FOXI1Q12951 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
FOXI1Q12951 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
FOXI1Q12951 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
FOXI1Q12951 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
FOXI1Q12951 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
FOXI1Q12951 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
FOXI1Q12951 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
FOXI1Q12951 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
FOXI1Q12951 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
FOXI1Q12951 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
FOXI1Q12951 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
FOXI1Q12951 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
FOXI1Q12951 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
FOXI1Q12951 KATNB1-201ENST00000379661 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
FOXI1Q12951 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
FOXI1Q12951 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
FOXI1Q12951 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
FOXI1Q12951 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
FOXI1Q12951 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
FOXI1Q12951 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
FOXI1Q12951 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
FOXI1Q12951 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
FOXI1Q12951 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
FOXI1Q12951 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
FOXI1Q12951 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
FOXI1Q12951 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
FOXI1Q12951 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
FOXI1Q12951 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
FOXI1Q12951 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
FOXI1Q12951 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
FOXI1Q12951 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
FOXI1Q12951 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms