Protein–RNA interactions for Protein: Q07864

POLE, DNA polymerase epsilon catalytic subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 2,286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLEQ07864 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
POLEQ07864 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
POLEQ07864 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
POLEQ07864 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
POLEQ07864 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
POLEQ07864 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
POLEQ07864 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
POLEQ07864 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
POLEQ07864 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
POLEQ07864 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
POLEQ07864 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
POLEQ07864 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
POLEQ07864 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
POLEQ07864 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
POLEQ07864 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
POLEQ07864 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
POLEQ07864 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
POLEQ07864 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
POLEQ07864 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
POLEQ07864 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
POLEQ07864 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
POLEQ07864 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
POLEQ07864 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
POLEQ07864 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
POLEQ07864 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
POLEQ07864 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
POLEQ07864 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
POLEQ07864 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
POLEQ07864 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
POLEQ07864 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
POLEQ07864 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
POLEQ07864 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
POLEQ07864 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC14.54□□□□□ -0.08
POLEQ07864 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
POLEQ07864 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
POLEQ07864 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
POLEQ07864 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
POLEQ07864 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
POLEQ07864 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
POLEQ07864 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
POLEQ07864 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
POLEQ07864 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
POLEQ07864 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
POLEQ07864 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
POLEQ07864 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
POLEQ07864 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
POLEQ07864 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
POLEQ07864 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
POLEQ07864 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
POLEQ07864 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
POLEQ07864 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
POLEQ07864 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
POLEQ07864 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
POLEQ07864 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
POLEQ07864 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
POLEQ07864 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
POLEQ07864 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
POLEQ07864 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
POLEQ07864 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
POLEQ07864 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
POLEQ07864 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
POLEQ07864 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
POLEQ07864 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
POLEQ07864 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
POLEQ07864 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
POLEQ07864 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
POLEQ07864 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
POLEQ07864 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
POLEQ07864 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
POLEQ07864 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
POLEQ07864 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
POLEQ07864 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
POLEQ07864 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
POLEQ07864 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
POLEQ07864 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
POLEQ07864 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
POLEQ07864 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
POLEQ07864 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
POLEQ07864 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
POLEQ07864 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
POLEQ07864 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
POLEQ07864 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
POLEQ07864 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
POLEQ07864 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
POLEQ07864 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
POLEQ07864 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
POLEQ07864 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
POLEQ07864 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
POLEQ07864 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
POLEQ07864 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
POLEQ07864 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
POLEQ07864 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
POLEQ07864 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC14.53□□□□□ -0.08
POLEQ07864 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
POLEQ07864 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
POLEQ07864 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
POLEQ07864 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
POLEQ07864 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
POLEQ07864 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
POLEQ07864 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms