Protein–RNA interactions for Protein: Q06710

PAX8, Paired box protein Pax-8, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAX8Q06710 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PAX8Q06710 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PAX8Q06710 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PAX8Q06710 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PAX8Q06710 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
PAX8Q06710 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PAX8Q06710 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PAX8Q06710 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PAX8Q06710 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PAX8Q06710 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PAX8Q06710 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PAX8Q06710 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PAX8Q06710 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PAX8Q06710 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PAX8Q06710 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PAX8Q06710 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PAX8Q06710 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PAX8Q06710 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PAX8Q06710 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
PAX8Q06710 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
PAX8Q06710 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
PAX8Q06710 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
PAX8Q06710 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
PAX8Q06710 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
PAX8Q06710 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
PAX8Q06710 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
PAX8Q06710 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
PAX8Q06710 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
PAX8Q06710 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
PAX8Q06710 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PAX8Q06710 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PAX8Q06710 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
PAX8Q06710 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PAX8Q06710 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PAX8Q06710 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PAX8Q06710 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PAX8Q06710 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PAX8Q06710 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PAX8Q06710 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PAX8Q06710 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PAX8Q06710 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PAX8Q06710 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PAX8Q06710 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PAX8Q06710 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PAX8Q06710 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PAX8Q06710 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
PAX8Q06710 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PAX8Q06710 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PAX8Q06710 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PAX8Q06710 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PAX8Q06710 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PAX8Q06710 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PAX8Q06710 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PAX8Q06710 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PAX8Q06710 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PAX8Q06710 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
PAX8Q06710 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
PAX8Q06710 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PAX8Q06710 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PAX8Q06710 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PAX8Q06710 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PAX8Q06710 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
PAX8Q06710 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PAX8Q06710 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PAX8Q06710 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PAX8Q06710 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PAX8Q06710 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PAX8Q06710 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
PAX8Q06710 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
PAX8Q06710 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PAX8Q06710 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PAX8Q06710 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PAX8Q06710 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PAX8Q06710 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PAX8Q06710 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PAX8Q06710 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PAX8Q06710 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PAX8Q06710 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PAX8Q06710 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PAX8Q06710 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PAX8Q06710 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PAX8Q06710 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PAX8Q06710 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PAX8Q06710 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PAX8Q06710 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PAX8Q06710 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PAX8Q06710 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
PAX8Q06710 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PAX8Q06710 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PAX8Q06710 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PAX8Q06710 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PAX8Q06710 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PAX8Q06710 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PAX8Q06710 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PAX8Q06710 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PAX8Q06710 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PAX8Q06710 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PAX8Q06710 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PAX8Q06710 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PAX8Q06710 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms