Protein–RNA interactions for Protein: Q06643

LTB, Lymphotoxin-beta, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBQ06643 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
LTBQ06643 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
LTBQ06643 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LTBQ06643 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
LTBQ06643 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LTBQ06643 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LTBQ06643 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LTBQ06643 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LTBQ06643 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LTBQ06643 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LTBQ06643 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LTBQ06643 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
LTBQ06643 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC15.04■□□□□ -0
LTBQ06643 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC15.04■□□□□ -0
LTBQ06643 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LTBQ06643 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC15.04■□□□□ -0
LTBQ06643 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LTBQ06643 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LTBQ06643 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LTBQ06643 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LTBQ06643 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC15.04■□□□□ -0
LTBQ06643 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
LTBQ06643 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LTBQ06643 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
LTBQ06643 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
LTBQ06643 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LTBQ06643 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
LTBQ06643 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
LTBQ06643 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC15.04■□□□□ -0
LTBQ06643 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
LTBQ06643 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
LTBQ06643 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
LTBQ06643 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LTBQ06643 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LTBQ06643 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LTBQ06643 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
LTBQ06643 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LTBQ06643 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LTBQ06643 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
LTBQ06643 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LTBQ06643 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
LTBQ06643 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LTBQ06643 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
LTBQ06643 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
LTBQ06643 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LTBQ06643 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
LTBQ06643 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
LTBQ06643 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
LTBQ06643 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LTBQ06643 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
LTBQ06643 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
LTBQ06643 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
LTBQ06643 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
LTBQ06643 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
LTBQ06643 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
LTBQ06643 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
LTBQ06643 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LTBQ06643 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
LTBQ06643 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LTBQ06643 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
LTBQ06643 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
LTBQ06643 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
LTBQ06643 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC15.03■□□□□ -0
LTBQ06643 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC15.03■□□□□ -0
LTBQ06643 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LTBQ06643 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
LTBQ06643 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
LTBQ06643 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
LTBQ06643 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
LTBQ06643 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC15.03■□□□□ -0
LTBQ06643 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
LTBQ06643 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
LTBQ06643 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
LTBQ06643 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC15.03■□□□□ -0
LTBQ06643 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
LTBQ06643 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LTBQ06643 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
LTBQ06643 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LTBQ06643 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LTBQ06643 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
LTBQ06643 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LTBQ06643 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
LTBQ06643 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
LTBQ06643 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LTBQ06643 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LTBQ06643 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
LTBQ06643 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
LTBQ06643 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
LTBQ06643 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
LTBQ06643 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
LTBQ06643 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
LTBQ06643 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
LTBQ06643 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
LTBQ06643 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC15.02■□□□□ -0
LTBQ06643 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC15.02■□□□□ -0
LTBQ06643 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
LTBQ06643 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
LTBQ06643 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LTBQ06643 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC15.02■□□□□ -0
LTBQ06643 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms