Protein–RNA interactions for Protein: Q05D32

CTDSPL2, CTD small phosphatase-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSPL2Q05D32 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CTDSPL2Q05D32 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CTDSPL2Q05D32 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CTDSPL2Q05D32 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CTDSPL2Q05D32 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CTDSPL2Q05D32 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CTDSPL2Q05D32 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CTDSPL2Q05D32 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CTDSPL2Q05D32 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CTDSPL2Q05D32 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CTDSPL2Q05D32 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CTDSPL2Q05D32 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CTDSPL2Q05D32 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CTDSPL2Q05D32 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CTDSPL2Q05D32 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
CTDSPL2Q05D32 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CTDSPL2Q05D32 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CTDSPL2Q05D32 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CTDSPL2Q05D32 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
CTDSPL2Q05D32 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CTDSPL2Q05D32 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CTDSPL2Q05D32 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CTDSPL2Q05D32 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CTDSPL2Q05D32 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
CTDSPL2Q05D32 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CTDSPL2Q05D32 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CTDSPL2Q05D32 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
CTDSPL2Q05D32 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CTDSPL2Q05D32 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CTDSPL2Q05D32 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CTDSPL2Q05D32 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CTDSPL2Q05D32 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CTDSPL2Q05D32 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CTDSPL2Q05D32 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CTDSPL2Q05D32 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CTDSPL2Q05D32 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CTDSPL2Q05D32 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CTDSPL2Q05D32 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CTDSPL2Q05D32 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CTDSPL2Q05D32 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CTDSPL2Q05D32 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CTDSPL2Q05D32 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CTDSPL2Q05D32 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CTDSPL2Q05D32 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CTDSPL2Q05D32 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CTDSPL2Q05D32 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CTDSPL2Q05D32 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CTDSPL2Q05D32 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CTDSPL2Q05D32 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CTDSPL2Q05D32 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CTDSPL2Q05D32 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CTDSPL2Q05D32 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
CTDSPL2Q05D32 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CTDSPL2Q05D32 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CTDSPL2Q05D32 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CTDSPL2Q05D32 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CTDSPL2Q05D32 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CTDSPL2Q05D32 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CTDSPL2Q05D32 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
CTDSPL2Q05D32 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CTDSPL2Q05D32 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CTDSPL2Q05D32 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CTDSPL2Q05D32 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CTDSPL2Q05D32 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CTDSPL2Q05D32 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CTDSPL2Q05D32 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CTDSPL2Q05D32 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CTDSPL2Q05D32 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CTDSPL2Q05D32 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CTDSPL2Q05D32 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
CTDSPL2Q05D32 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CTDSPL2Q05D32 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CTDSPL2Q05D32 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CTDSPL2Q05D32 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CTDSPL2Q05D32 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CTDSPL2Q05D32 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CTDSPL2Q05D32 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CTDSPL2Q05D32 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CTDSPL2Q05D32 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CTDSPL2Q05D32 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CTDSPL2Q05D32 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CTDSPL2Q05D32 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CTDSPL2Q05D32 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CTDSPL2Q05D32 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CTDSPL2Q05D32 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CTDSPL2Q05D32 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CTDSPL2Q05D32 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CTDSPL2Q05D32 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CTDSPL2Q05D32 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CTDSPL2Q05D32 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CTDSPL2Q05D32 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CTDSPL2Q05D32 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
CTDSPL2Q05D32 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CTDSPL2Q05D32 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CTDSPL2Q05D32 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CTDSPL2Q05D32 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CTDSPL2Q05D32 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CTDSPL2Q05D32 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CTDSPL2Q05D32 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CTDSPL2Q05D32 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64 ms