Protein–RNA interactions for Protein: Q02577

NHLH2, Helix-loop-helix protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHLH2Q02577 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NHLH2Q02577 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NHLH2Q02577 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
NHLH2Q02577 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
NHLH2Q02577 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NHLH2Q02577 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
NHLH2Q02577 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
NHLH2Q02577 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
NHLH2Q02577 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NHLH2Q02577 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NHLH2Q02577 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
NHLH2Q02577 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NHLH2Q02577 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
NHLH2Q02577 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
NHLH2Q02577 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
NHLH2Q02577 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
NHLH2Q02577 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
NHLH2Q02577 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
NHLH2Q02577 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
NHLH2Q02577 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
NHLH2Q02577 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
NHLH2Q02577 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
NHLH2Q02577 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NHLH2Q02577 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
NHLH2Q02577 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NHLH2Q02577 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NHLH2Q02577 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NHLH2Q02577 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
NHLH2Q02577 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
NHLH2Q02577 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
NHLH2Q02577 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NHLH2Q02577 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
NHLH2Q02577 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NHLH2Q02577 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
NHLH2Q02577 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NHLH2Q02577 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
NHLH2Q02577 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NHLH2Q02577 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NHLH2Q02577 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
NHLH2Q02577 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NHLH2Q02577 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
NHLH2Q02577 USP31-203ENST00000567975 2142 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
NHLH2Q02577 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NHLH2Q02577 GRB2-203ENST00000392562 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
NHLH2Q02577 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
NHLH2Q02577 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NHLH2Q02577 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NHLH2Q02577 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NHLH2Q02577 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NHLH2Q02577 LINC00887-202ENST00000414120 2880 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
NHLH2Q02577 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NHLH2Q02577 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NHLH2Q02577 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
NHLH2Q02577 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NHLH2Q02577 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NHLH2Q02577 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
NHLH2Q02577 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NHLH2Q02577 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NHLH2Q02577 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NHLH2Q02577 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
NHLH2Q02577 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NHLH2Q02577 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
NHLH2Q02577 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NHLH2Q02577 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NHLH2Q02577 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
NHLH2Q02577 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
NHLH2Q02577 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
NHLH2Q02577 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NHLH2Q02577 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NHLH2Q02577 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
NHLH2Q02577 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NHLH2Q02577 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
NHLH2Q02577 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NHLH2Q02577 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NHLH2Q02577 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NHLH2Q02577 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NHLH2Q02577 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NHLH2Q02577 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NHLH2Q02577 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
NHLH2Q02577 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NHLH2Q02577 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
NHLH2Q02577 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
NHLH2Q02577 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
NHLH2Q02577 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
NHLH2Q02577 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
NHLH2Q02577 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NHLH2Q02577 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
NHLH2Q02577 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
NHLH2Q02577 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
NHLH2Q02577 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NHLH2Q02577 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
NHLH2Q02577 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
NHLH2Q02577 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NHLH2Q02577 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
NHLH2Q02577 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NHLH2Q02577 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
NHLH2Q02577 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC13.39□□□□□ -0.27
NHLH2Q02577 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NHLH2Q02577 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
NHLH2Q02577 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms