Protein–RNA interactions for Protein: P81133

SIM1, Single-minded homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIM1P81133 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SIM1P81133 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SIM1P81133 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SIM1P81133 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SIM1P81133 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SIM1P81133 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SIM1P81133 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SIM1P81133 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SIM1P81133 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SIM1P81133 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SIM1P81133 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SIM1P81133 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SIM1P81133 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SIM1P81133 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SIM1P81133 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SIM1P81133 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SIM1P81133 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SIM1P81133 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SIM1P81133 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SIM1P81133 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SIM1P81133 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SIM1P81133 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SIM1P81133 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SIM1P81133 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SIM1P81133 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SIM1P81133 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SIM1P81133 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SIM1P81133 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SIM1P81133 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SIM1P81133 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SIM1P81133 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SIM1P81133 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SIM1P81133 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SIM1P81133 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SIM1P81133 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SIM1P81133 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SIM1P81133 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SIM1P81133 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SIM1P81133 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SIM1P81133 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SIM1P81133 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SIM1P81133 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SIM1P81133 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SIM1P81133 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SIM1P81133 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SIM1P81133 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SIM1P81133 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SIM1P81133 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SIM1P81133 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SIM1P81133 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SIM1P81133 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SIM1P81133 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SIM1P81133 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SIM1P81133 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SIM1P81133 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SIM1P81133 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SIM1P81133 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SIM1P81133 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SIM1P81133 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SIM1P81133 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SIM1P81133 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SIM1P81133 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SIM1P81133 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SIM1P81133 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SIM1P81133 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SIM1P81133 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SIM1P81133 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SIM1P81133 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SIM1P81133 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SIM1P81133 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SIM1P81133 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SIM1P81133 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SIM1P81133 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SIM1P81133 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SIM1P81133 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SIM1P81133 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SIM1P81133 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SIM1P81133 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SIM1P81133 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SIM1P81133 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SIM1P81133 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SIM1P81133 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SIM1P81133 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SIM1P81133 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SIM1P81133 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SIM1P81133 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SIM1P81133 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SIM1P81133 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SIM1P81133 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SIM1P81133 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SIM1P81133 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SIM1P81133 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SIM1P81133 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SIM1P81133 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SIM1P81133 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SIM1P81133 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SIM1P81133 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SIM1P81133 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SIM1P81133 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SIM1P81133 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.6 ms