Protein–RNA interactions for Protein: P63121

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Pro protein, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P63121 UBE3A-204ENST00000438097 8939 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
HERVK_113P63121 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
HERVK_113P63121 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
HERVK_113P63121 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
HERVK_113P63121 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
HERVK_113P63121 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
HERVK_113P63121 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
HERVK_113P63121 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
HERVK_113P63121 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
HERVK_113P63121 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
HERVK_113P63121 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
HERVK_113P63121 OTOF-202ENST00000338581 4954 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
HERVK_113P63121 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
HERVK_113P63121 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
HERVK_113P63121 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
HERVK_113P63121 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
HERVK_113P63121 ZNF618-201ENST00000288466 9109 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
HERVK_113P63121 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
HERVK_113P63121 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
HERVK_113P63121 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
HERVK_113P63121 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
HERVK_113P63121 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
HERVK_113P63121 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
HERVK_113P63121 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
HERVK_113P63121 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
HERVK_113P63121 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
HERVK_113P63121 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
HERVK_113P63121 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
HERVK_113P63121 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
HERVK_113P63121 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
HERVK_113P63121 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
HERVK_113P63121 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
HERVK_113P63121 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
HERVK_113P63121 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
HERVK_113P63121 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
HERVK_113P63121 RREB1-202ENST00000349384 7440 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
HERVK_113P63121 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
HERVK_113P63121 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
HERVK_113P63121 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
HERVK_113P63121 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
HERVK_113P63121 GRB2-203ENST00000392562 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
HERVK_113P63121 P2RY1-201ENST00000305097 6747 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
HERVK_113P63121 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
HERVK_113P63121 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
HERVK_113P63121 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
HERVK_113P63121 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
HERVK_113P63121 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
HERVK_113P63121 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
HERVK_113P63121 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
HERVK_113P63121 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
HERVK_113P63121 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
HERVK_113P63121 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
HERVK_113P63121 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
HERVK_113P63121 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
HERVK_113P63121 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
HERVK_113P63121 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
HERVK_113P63121 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
HERVK_113P63121 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
HERVK_113P63121 GCM2-201ENST00000379491 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
HERVK_113P63121 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
HERVK_113P63121 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
HERVK_113P63121 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC11.42□□□□□ -0.58
HERVK_113P63121 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
HERVK_113P63121 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
HERVK_113P63121 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
HERVK_113P63121 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
HERVK_113P63121 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
HERVK_113P63121 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
HERVK_113P63121 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
HERVK_113P63121 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
HERVK_113P63121 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
HERVK_113P63121 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
HERVK_113P63121 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
HERVK_113P63121 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
HERVK_113P63121 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
HERVK_113P63121 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
HERVK_113P63121 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC11.42□□□□□ -0.58
HERVK_113P63121 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
HERVK_113P63121 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
HERVK_113P63121 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
HERVK_113P63121 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
HERVK_113P63121 VSIR-201ENST00000394957 4689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
HERVK_113P63121 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
HERVK_113P63121 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
HERVK_113P63121 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
HERVK_113P63121 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
HERVK_113P63121 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
HERVK_113P63121 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
HERVK_113P63121 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
HERVK_113P63121 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
HERVK_113P63121 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
HERVK_113P63121 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
HERVK_113P63121 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
HERVK_113P63121 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
HERVK_113P63121 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
HERVK_113P63121 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
HERVK_113P63121 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
HERVK_113P63121 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
HERVK_113P63121 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
HERVK_113P63121 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms