Protein–RNA interactions for Protein: P61221

ABCE1, ATP-binding cassette sub-family E member 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCE1P61221 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ABCE1P61221 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ABCE1P61221 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ABCE1P61221 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ABCE1P61221 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ABCE1P61221 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ABCE1P61221 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ABCE1P61221 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ABCE1P61221 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ABCE1P61221 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ABCE1P61221 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ABCE1P61221 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ABCE1P61221 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ABCE1P61221 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ABCE1P61221 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ABCE1P61221 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ABCE1P61221 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ABCE1P61221 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ABCE1P61221 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ABCE1P61221 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ABCE1P61221 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ABCE1P61221 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ABCE1P61221 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
ABCE1P61221 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ABCE1P61221 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ABCE1P61221 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ABCE1P61221 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ABCE1P61221 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ABCE1P61221 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ABCE1P61221 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ABCE1P61221 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ABCE1P61221 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ABCE1P61221 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ABCE1P61221 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ABCE1P61221 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ABCE1P61221 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ABCE1P61221 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ABCE1P61221 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ABCE1P61221 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ABCE1P61221 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ABCE1P61221 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ABCE1P61221 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ABCE1P61221 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ABCE1P61221 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ABCE1P61221 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ABCE1P61221 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ABCE1P61221 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ABCE1P61221 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ABCE1P61221 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ABCE1P61221 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ABCE1P61221 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ABCE1P61221 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ABCE1P61221 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ABCE1P61221 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ABCE1P61221 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ABCE1P61221 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ABCE1P61221 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ABCE1P61221 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ABCE1P61221 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ABCE1P61221 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ABCE1P61221 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ABCE1P61221 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ABCE1P61221 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ABCE1P61221 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ABCE1P61221 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ABCE1P61221 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ABCE1P61221 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ABCE1P61221 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ABCE1P61221 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ABCE1P61221 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ABCE1P61221 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ABCE1P61221 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ABCE1P61221 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ABCE1P61221 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ABCE1P61221 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ABCE1P61221 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ABCE1P61221 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ABCE1P61221 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
ABCE1P61221 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ABCE1P61221 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ABCE1P61221 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ABCE1P61221 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ABCE1P61221 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ABCE1P61221 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ABCE1P61221 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
ABCE1P61221 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ABCE1P61221 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
ABCE1P61221 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ABCE1P61221 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ABCE1P61221 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ABCE1P61221 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ABCE1P61221 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
ABCE1P61221 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ABCE1P61221 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ABCE1P61221 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ABCE1P61221 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ABCE1P61221 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ABCE1P61221 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ABCE1P61221 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ABCE1P61221 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms