Protein–RNA interactions for Protein: P60880

SNAP25, Synaptosomal-associated protein 25, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAP25P60880 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SNAP25P60880 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SNAP25P60880 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SNAP25P60880 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SNAP25P60880 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SNAP25P60880 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SNAP25P60880 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SNAP25P60880 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SNAP25P60880 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SNAP25P60880 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SNAP25P60880 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SNAP25P60880 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SNAP25P60880 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SNAP25P60880 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SNAP25P60880 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SNAP25P60880 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SNAP25P60880 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SNAP25P60880 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SNAP25P60880 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SNAP25P60880 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SNAP25P60880 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SNAP25P60880 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SNAP25P60880 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
SNAP25P60880 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SNAP25P60880 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SNAP25P60880 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SNAP25P60880 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SNAP25P60880 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SNAP25P60880 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SNAP25P60880 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
SNAP25P60880 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SNAP25P60880 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SNAP25P60880 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
SNAP25P60880 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
SNAP25P60880 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SNAP25P60880 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
SNAP25P60880 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SNAP25P60880 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SNAP25P60880 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SNAP25P60880 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SNAP25P60880 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
SNAP25P60880 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SNAP25P60880 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SNAP25P60880 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SNAP25P60880 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SNAP25P60880 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SNAP25P60880 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SNAP25P60880 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SNAP25P60880 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SNAP25P60880 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
SNAP25P60880 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SNAP25P60880 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SNAP25P60880 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SNAP25P60880 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SNAP25P60880 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SNAP25P60880 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SNAP25P60880 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SNAP25P60880 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SNAP25P60880 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SNAP25P60880 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SNAP25P60880 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
SNAP25P60880 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SNAP25P60880 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SNAP25P60880 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SNAP25P60880 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SNAP25P60880 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SNAP25P60880 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SNAP25P60880 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SNAP25P60880 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SNAP25P60880 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SNAP25P60880 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SNAP25P60880 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SNAP25P60880 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SNAP25P60880 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SNAP25P60880 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SNAP25P60880 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SNAP25P60880 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SNAP25P60880 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
SNAP25P60880 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
SNAP25P60880 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SNAP25P60880 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
SNAP25P60880 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SNAP25P60880 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SNAP25P60880 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SNAP25P60880 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SNAP25P60880 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SNAP25P60880 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SNAP25P60880 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SNAP25P60880 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SNAP25P60880 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SNAP25P60880 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SNAP25P60880 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SNAP25P60880 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
SNAP25P60880 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
SNAP25P60880 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SNAP25P60880 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
SNAP25P60880 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SNAP25P60880 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SNAP25P60880 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SNAP25P60880 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.1 ms