Protein–RNA interactions for Protein: P60508

ERVFRD-1, Syncytin-2, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFRD-1P60508 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ERVFRD-1P60508 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ERVFRD-1P60508 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ERVFRD-1P60508 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ERVFRD-1P60508 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ERVFRD-1P60508 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ERVFRD-1P60508 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ERVFRD-1P60508 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ERVFRD-1P60508 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ERVFRD-1P60508 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
ERVFRD-1P60508 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ERVFRD-1P60508 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ERVFRD-1P60508 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ERVFRD-1P60508 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ERVFRD-1P60508 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ERVFRD-1P60508 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ERVFRD-1P60508 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ERVFRD-1P60508 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ERVFRD-1P60508 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ERVFRD-1P60508 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ERVFRD-1P60508 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ERVFRD-1P60508 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
ERVFRD-1P60508 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ERVFRD-1P60508 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ERVFRD-1P60508 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ERVFRD-1P60508 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ERVFRD-1P60508 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
ERVFRD-1P60508 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ERVFRD-1P60508 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
ERVFRD-1P60508 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
ERVFRD-1P60508 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
ERVFRD-1P60508 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
ERVFRD-1P60508 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
ERVFRD-1P60508 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
ERVFRD-1P60508 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
ERVFRD-1P60508 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ERVFRD-1P60508 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ERVFRD-1P60508 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
ERVFRD-1P60508 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ERVFRD-1P60508 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ERVFRD-1P60508 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ERVFRD-1P60508 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
ERVFRD-1P60508 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC13.88□□□□□ -0.19
ERVFRD-1P60508 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
ERVFRD-1P60508 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
ERVFRD-1P60508 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ERVFRD-1P60508 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
ERVFRD-1P60508 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
ERVFRD-1P60508 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
ERVFRD-1P60508 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
ERVFRD-1P60508 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
ERVFRD-1P60508 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
ERVFRD-1P60508 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ERVFRD-1P60508 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ERVFRD-1P60508 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
ERVFRD-1P60508 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ERVFRD-1P60508 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
ERVFRD-1P60508 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
ERVFRD-1P60508 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
ERVFRD-1P60508 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
ERVFRD-1P60508 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ERVFRD-1P60508 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
ERVFRD-1P60508 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
ERVFRD-1P60508 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC13.88□□□□□ -0.19
ERVFRD-1P60508 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
ERVFRD-1P60508 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ERVFRD-1P60508 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
ERVFRD-1P60508 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ERVFRD-1P60508 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ERVFRD-1P60508 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
ERVFRD-1P60508 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
ERVFRD-1P60508 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
ERVFRD-1P60508 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
ERVFRD-1P60508 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
ERVFRD-1P60508 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
ERVFRD-1P60508 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
ERVFRD-1P60508 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
ERVFRD-1P60508 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
ERVFRD-1P60508 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
ERVFRD-1P60508 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
ERVFRD-1P60508 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
ERVFRD-1P60508 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
ERVFRD-1P60508 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
ERVFRD-1P60508 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
ERVFRD-1P60508 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
ERVFRD-1P60508 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
ERVFRD-1P60508 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
ERVFRD-1P60508 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
ERVFRD-1P60508 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
ERVFRD-1P60508 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
ERVFRD-1P60508 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
ERVFRD-1P60508 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
ERVFRD-1P60508 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
ERVFRD-1P60508 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
ERVFRD-1P60508 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
ERVFRD-1P60508 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
ERVFRD-1P60508 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
ERVFRD-1P60508 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
ERVFRD-1P60508 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
ERVFRD-1P60508 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms