Protein–RNA interactions for Protein: P59190

RAB15, Ras-related protein Rab-15, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB15P59190 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB15P59190 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB15P59190 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB15P59190 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB15P59190 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB15P59190 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB15P59190 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB15P59190 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB15P59190 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB15P59190 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB15P59190 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB15P59190 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB15P59190 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB15P59190 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB15P59190 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB15P59190 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB15P59190 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB15P59190 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB15P59190 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB15P59190 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB15P59190 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB15P59190 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB15P59190 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB15P59190 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB15P59190 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB15P59190 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB15P59190 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB15P59190 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB15P59190 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB15P59190 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB15P59190 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB15P59190 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB15P59190 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB15P59190 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB15P59190 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB15P59190 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB15P59190 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB15P59190 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB15P59190 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB15P59190 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB15P59190 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB15P59190 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB15P59190 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB15P59190 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB15P59190 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB15P59190 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB15P59190 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB15P59190 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB15P59190 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB15P59190 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB15P59190 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB15P59190 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB15P59190 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB15P59190 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB15P59190 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB15P59190 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB15P59190 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB15P59190 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB15P59190 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB15P59190 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB15P59190 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB15P59190 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB15P59190 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB15P59190 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB15P59190 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB15P59190 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB15P59190 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB15P59190 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB15P59190 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB15P59190 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB15P59190 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB15P59190 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB15P59190 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB15P59190 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB15P59190 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB15P59190 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB15P59190 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB15P59190 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB15P59190 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB15P59190 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB15P59190 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB15P59190 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB15P59190 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB15P59190 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB15P59190 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB15P59190 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB15P59190 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB15P59190 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB15P59190 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB15P59190 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB15P59190 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB15P59190 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB15P59190 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB15P59190 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB15P59190 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB15P59190 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB15P59190 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB15P59190 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB15P59190 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB15P59190 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms