Protein–RNA interactions for Protein: P51587

BRCA2, Breast cancer type 2 susceptibility protein, humanhuman

Predictions only

Length 3,418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRCA2P51587 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BRCA2P51587 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BRCA2P51587 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BRCA2P51587 CSNK2B-201ENST00000375865 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BRCA2P51587 PGAP2-224ENST00000490830 810 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BRCA2P51587 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BRCA2P51587 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BRCA2P51587 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BRCA2P51587 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BRCA2P51587 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BRCA2P51587 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BRCA2P51587 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BRCA2P51587 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BRCA2P51587 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BRCA2P51587 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BRCA2P51587 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BRCA2P51587 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BRCA2P51587 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BRCA2P51587 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BRCA2P51587 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BRCA2P51587 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BRCA2P51587 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BRCA2P51587 MPV17-204ENST00000399052 749 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BRCA2P51587 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BRCA2P51587 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BRCA2P51587 DNAJC17-212ENST00000627802 428 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BRCA2P51587 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BRCA2P51587 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BRCA2P51587 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BRCA2P51587 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BRCA2P51587 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BRCA2P51587 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BRCA2P51587 LYRM4-206ENST00000468929 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BRCA2P51587 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
BRCA2P51587 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
BRCA2P51587 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
BRCA2P51587 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
BRCA2P51587 RN7SL555P-201ENST00000584742 339 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
BRCA2P51587 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
BRCA2P51587 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BRCA2P51587 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BRCA2P51587 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BRCA2P51587 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BRCA2P51587 CABP1-203ENST00000351200 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BRCA2P51587 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BRCA2P51587 FAM3B-203ENST00000398647 864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BRCA2P51587 FAM3B-204ENST00000398652 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BRCA2P51587 CD8A-204ENST00000409781 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
BRCA2P51587 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
BRCA2P51587 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
BRCA2P51587 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
BRCA2P51587 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BRCA2P51587 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
BRCA2P51587 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BRCA2P51587 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BRCA2P51587 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BRCA2P51587 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
BRCA2P51587 BEX2-201ENST00000372674 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
BRCA2P51587 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
BRCA2P51587 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
BRCA2P51587 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
BRCA2P51587 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BRCA2P51587 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
BRCA2P51587 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
BRCA2P51587 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
BRCA2P51587 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
BRCA2P51587 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
BRCA2P51587 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
BRCA2P51587 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
BRCA2P51587 ANK1-203ENST00000314214 1185 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BRCA2P51587 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BRCA2P51587 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
BRCA2P51587 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BRCA2P51587 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BRCA2P51587 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
BRCA2P51587 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BRCA2P51587 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
BRCA2P51587 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BRCA2P51587 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BRCA2P51587 TMEM256-201ENST00000302422 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BRCA2P51587 IMP3P2-201ENST00000489760 475 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
BRCA2P51587 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
BRCA2P51587 AC105105.3-201ENST00000585470 646 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
BRCA2P51587 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
BRCA2P51587 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
BRCA2P51587 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
BRCA2P51587 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
BRCA2P51587 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BRCA2P51587 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BRCA2P51587 NDUFB8-201ENST00000299166 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BRCA2P51587 DKFZp779M0652-201ENST00000378779 649 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BRCA2P51587 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BRCA2P51587 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BRCA2P51587 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BRCA2P51587 ADM-202ENST00000524948 584 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
BRCA2P51587 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BRCA2P51587 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
BRCA2P51587 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BRCA2P51587 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BRCA2P51587 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms