Protein–RNA interactions for Protein: P35222

CTNNB1, Catenin beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNB1P35222 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CTNNB1P35222 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CTNNB1P35222 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CTNNB1P35222 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CTNNB1P35222 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CTNNB1P35222 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CTNNB1P35222 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CTNNB1P35222 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CTNNB1P35222 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CTNNB1P35222 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CTNNB1P35222 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CTNNB1P35222 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CTNNB1P35222 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CTNNB1P35222 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CTNNB1P35222 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CTNNB1P35222 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CTNNB1P35222 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CTNNB1P35222 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CTNNB1P35222 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
CTNNB1P35222 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CTNNB1P35222 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CTNNB1P35222 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CTNNB1P35222 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
CTNNB1P35222 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CTNNB1P35222 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CTNNB1P35222 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CTNNB1P35222 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CTNNB1P35222 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CTNNB1P35222 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CTNNB1P35222 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CTNNB1P35222 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CTNNB1P35222 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CTNNB1P35222 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CTNNB1P35222 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CTNNB1P35222 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CTNNB1P35222 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CTNNB1P35222 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CTNNB1P35222 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CTNNB1P35222 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CTNNB1P35222 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CTNNB1P35222 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CTNNB1P35222 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CTNNB1P35222 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CTNNB1P35222 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CTNNB1P35222 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CTNNB1P35222 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CTNNB1P35222 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CTNNB1P35222 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CTNNB1P35222 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CTNNB1P35222 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CTNNB1P35222 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CTNNB1P35222 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CTNNB1P35222 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CTNNB1P35222 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CTNNB1P35222 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CTNNB1P35222 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CTNNB1P35222 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CTNNB1P35222 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CTNNB1P35222 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CTNNB1P35222 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CTNNB1P35222 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CTNNB1P35222 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CTNNB1P35222 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CTNNB1P35222 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CTNNB1P35222 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CTNNB1P35222 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CTNNB1P35222 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CTNNB1P35222 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CTNNB1P35222 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CTNNB1P35222 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CTNNB1P35222 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CTNNB1P35222 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CTNNB1P35222 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CTNNB1P35222 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CTNNB1P35222 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CTNNB1P35222 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CTNNB1P35222 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CTNNB1P35222 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CTNNB1P35222 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CTNNB1P35222 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CTNNB1P35222 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CTNNB1P35222 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CTNNB1P35222 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CTNNB1P35222 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CTNNB1P35222 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CTNNB1P35222 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CTNNB1P35222 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CTNNB1P35222 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CTNNB1P35222 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CTNNB1P35222 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CTNNB1P35222 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
CTNNB1P35222 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CTNNB1P35222 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CTNNB1P35222 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CTNNB1P35222 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
CTNNB1P35222 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CTNNB1P35222 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CTNNB1P35222 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CTNNB1P35222 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CTNNB1P35222 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms