Protein–RNA interactions for Protein: P29466

CASP1, Caspase-1, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP1P29466 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CASP1P29466 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CASP1P29466 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CASP1P29466 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CASP1P29466 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CASP1P29466 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CASP1P29466 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CASP1P29466 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CASP1P29466 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CASP1P29466 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CASP1P29466 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CASP1P29466 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CASP1P29466 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CASP1P29466 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CASP1P29466 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CASP1P29466 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CASP1P29466 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CASP1P29466 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CASP1P29466 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CASP1P29466 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CASP1P29466 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CASP1P29466 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CASP1P29466 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CASP1P29466 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CASP1P29466 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CASP1P29466 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CASP1P29466 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CASP1P29466 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CASP1P29466 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CASP1P29466 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CASP1P29466 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CASP1P29466 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CASP1P29466 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
CASP1P29466 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
CASP1P29466 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CASP1P29466 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CASP1P29466 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CASP1P29466 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
CASP1P29466 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CASP1P29466 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CASP1P29466 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CASP1P29466 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CASP1P29466 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CASP1P29466 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CASP1P29466 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CASP1P29466 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CASP1P29466 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CASP1P29466 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CASP1P29466 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CASP1P29466 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CASP1P29466 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CASP1P29466 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CASP1P29466 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CASP1P29466 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CASP1P29466 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CASP1P29466 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CASP1P29466 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CASP1P29466 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CASP1P29466 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CASP1P29466 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CASP1P29466 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CASP1P29466 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CASP1P29466 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CASP1P29466 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CASP1P29466 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CASP1P29466 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CASP1P29466 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CASP1P29466 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CASP1P29466 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CASP1P29466 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CASP1P29466 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CASP1P29466 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CASP1P29466 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CASP1P29466 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CASP1P29466 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CASP1P29466 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CASP1P29466 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CASP1P29466 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CASP1P29466 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CASP1P29466 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CASP1P29466 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CASP1P29466 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CASP1P29466 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CASP1P29466 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CASP1P29466 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CASP1P29466 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CASP1P29466 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CASP1P29466 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CASP1P29466 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CASP1P29466 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CASP1P29466 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CASP1P29466 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
CASP1P29466 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CASP1P29466 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CASP1P29466 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CASP1P29466 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CASP1P29466 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CASP1P29466 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CASP1P29466 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CASP1P29466 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms