Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

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Length 700 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTPREP23469 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTPREP23469 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTPREP23469 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTPREP23469 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
PTPREP23469 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTPREP23469 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTPREP23469 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTPREP23469 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
PTPREP23469 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
PTPREP23469 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTPREP23469 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTPREP23469 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTPREP23469 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTPREP23469 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTPREP23469 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTPREP23469 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
PTPREP23469 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
PTPREP23469 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.66
PTPREP23469 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC19.14■□□□□ 0.66
PTPREP23469 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
PTPREP23469 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
PTPREP23469 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
PTPREP23469 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTPREP23469 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTPREP23469 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTPREP23469 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTPREP23469 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTPREP23469 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTPREP23469 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTPREP23469 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTPREP23469 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTPREP23469 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTPREP23469 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTPREP23469 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTPREP23469 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
PTPREP23469 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTPREP23469 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTPREP23469 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTPREP23469 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTPREP23469 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTPREP23469 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTPREP23469 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTPREP23469 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTPREP23469 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTPREP23469 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTPREP23469 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTPREP23469 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTPREP23469 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTPREP23469 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTPREP23469 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
PTPREP23469 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTPREP23469 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTPREP23469 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
PTPREP23469 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTPREP23469 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTPREP23469 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTPREP23469 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
PTPREP23469 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTPREP23469 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTPREP23469 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTPREP23469 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTPREP23469 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTPREP23469 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTPREP23469 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
PTPREP23469 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTPREP23469 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTPREP23469 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTPREP23469 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTPREP23469 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTPREP23469 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTPREP23469 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTPREP23469 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTPREP23469 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTPREP23469 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTPREP23469 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTPREP23469 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTPREP23469 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTPREP23469 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTPREP23469 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTPREP23469 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTPREP23469 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTPREP23469 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTPREP23469 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTPREP23469 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTPREP23469 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
PTPREP23469 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTPREP23469 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTPREP23469 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTPREP23469 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTPREP23469 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
PTPREP23469 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTPREP23469 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTPREP23469 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
PTPREP23469 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTPREP23469 LINC02536-201ENST00000625799 625 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTPREP23469 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTPREP23469 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTPREP23469 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTPREP23469 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
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