Protein–RNA interactions for Protein: P23468

PTPRD, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRDP23468 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTPRDP23468 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTPRDP23468 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTPRDP23468 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTPRDP23468 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTPRDP23468 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTPRDP23468 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTPRDP23468 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
PTPRDP23468 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTPRDP23468 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
PTPRDP23468 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTPRDP23468 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTPRDP23468 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTPRDP23468 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
PTPRDP23468 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
PTPRDP23468 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
PTPRDP23468 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTPRDP23468 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTPRDP23468 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTPRDP23468 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTPRDP23468 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTPRDP23468 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTPRDP23468 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTPRDP23468 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTPRDP23468 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PTPRDP23468 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PTPRDP23468 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PTPRDP23468 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PTPRDP23468 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PTPRDP23468 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PTPRDP23468 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PTPRDP23468 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PTPRDP23468 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PTPRDP23468 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PTPRDP23468 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PTPRDP23468 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PTPRDP23468 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PTPRDP23468 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PTPRDP23468 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PTPRDP23468 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PTPRDP23468 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PTPRDP23468 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PTPRDP23468 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PTPRDP23468 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PTPRDP23468 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PTPRDP23468 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PTPRDP23468 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PTPRDP23468 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PTPRDP23468 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PTPRDP23468 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PTPRDP23468 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PTPRDP23468 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PTPRDP23468 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PTPRDP23468 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
PTPRDP23468 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PTPRDP23468 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
PTPRDP23468 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PTPRDP23468 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PTPRDP23468 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
PTPRDP23468 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PTPRDP23468 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PTPRDP23468 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PTPRDP23468 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
PTPRDP23468 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
PTPRDP23468 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
PTPRDP23468 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
PTPRDP23468 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PTPRDP23468 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PTPRDP23468 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PTPRDP23468 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PTPRDP23468 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PTPRDP23468 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PTPRDP23468 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PTPRDP23468 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PTPRDP23468 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PTPRDP23468 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PTPRDP23468 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PTPRDP23468 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PTPRDP23468 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PTPRDP23468 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
PTPRDP23468 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PTPRDP23468 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PTPRDP23468 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PTPRDP23468 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PTPRDP23468 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PTPRDP23468 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PTPRDP23468 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PTPRDP23468 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PTPRDP23468 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PTPRDP23468 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PTPRDP23468 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PTPRDP23468 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
PTPRDP23468 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PTPRDP23468 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PTPRDP23468 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PTPRDP23468 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PTPRDP23468 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PTPRDP23468 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTPRDP23468 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTPRDP23468 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
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