Protein–RNA interactions for Protein: P23327

HRC, Sarcoplasmic reticulum histidine-rich calcium-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HRCP23327 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
HRCP23327 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
HRCP23327 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
HRCP23327 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
HRCP23327 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
HRCP23327 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
HRCP23327 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
HRCP23327 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
HRCP23327 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
HRCP23327 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
HRCP23327 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
HRCP23327 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
HRCP23327 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
HRCP23327 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
HRCP23327 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
HRCP23327 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
HRCP23327 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
HRCP23327 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
HRCP23327 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
HRCP23327 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
HRCP23327 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
HRCP23327 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
HRCP23327 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
HRCP23327 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
HRCP23327 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
HRCP23327 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
HRCP23327 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
HRCP23327 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
HRCP23327 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
HRCP23327 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
HRCP23327 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
HRCP23327 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
HRCP23327 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
HRCP23327 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
HRCP23327 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
HRCP23327 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC25.58■■□□□ 1.69
HRCP23327 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
HRCP23327 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
HRCP23327 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
HRCP23327 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
HRCP23327 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
HRCP23327 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
HRCP23327 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
HRCP23327 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
HRCP23327 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
HRCP23327 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
HRCP23327 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
HRCP23327 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
HRCP23327 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
HRCP23327 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
HRCP23327 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
HRCP23327 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
HRCP23327 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
HRCP23327 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
HRCP23327 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
HRCP23327 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
HRCP23327 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
HRCP23327 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
HRCP23327 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
HRCP23327 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
HRCP23327 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
HRCP23327 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
HRCP23327 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
HRCP23327 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
HRCP23327 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
HRCP23327 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
HRCP23327 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
HRCP23327 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
HRCP23327 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
HRCP23327 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
HRCP23327 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
HRCP23327 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
HRCP23327 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
HRCP23327 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
HRCP23327 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
HRCP23327 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
HRCP23327 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
HRCP23327 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
HRCP23327 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
HRCP23327 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
HRCP23327 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
HRCP23327 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
HRCP23327 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
HRCP23327 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
HRCP23327 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
HRCP23327 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
HRCP23327 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
HRCP23327 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
HRCP23327 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
HRCP23327 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
HRCP23327 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
HRCP23327 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
HRCP23327 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
HRCP23327 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
HRCP23327 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
HRCP23327 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
HRCP23327 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
HRCP23327 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
HRCP23327 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
HRCP23327 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms