Protein–RNA interactions for Protein: P20132

SDS, L-serine dehydratase/L-threonine deaminase, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDSP20132 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SDSP20132 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
SDSP20132 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SDSP20132 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SDSP20132 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SDSP20132 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SDSP20132 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SDSP20132 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SDSP20132 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SDSP20132 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC20■□□□□ 0.79
SDSP20132 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SDSP20132 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SDSP20132 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SDSP20132 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SDSP20132 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SDSP20132 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SDSP20132 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SDSP20132 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SDSP20132 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SDSP20132 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SDSP20132 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SDSP20132 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SDSP20132 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SDSP20132 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
SDSP20132 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SDSP20132 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SDSP20132 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SDSP20132 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SDSP20132 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SDSP20132 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SDSP20132 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SDSP20132 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SDSP20132 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SDSP20132 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SDSP20132 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SDSP20132 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SDSP20132 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SDSP20132 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SDSP20132 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SDSP20132 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SDSP20132 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SDSP20132 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SDSP20132 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SDSP20132 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SDSP20132 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
SDSP20132 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SDSP20132 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SDSP20132 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SDSP20132 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SDSP20132 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SDSP20132 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SDSP20132 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SDSP20132 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SDSP20132 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SDSP20132 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SDSP20132 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SDSP20132 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SDSP20132 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SDSP20132 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SDSP20132 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SDSP20132 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SDSP20132 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
SDSP20132 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SDSP20132 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SDSP20132 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SDSP20132 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SDSP20132 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SDSP20132 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
SDSP20132 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SDSP20132 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SDSP20132 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SDSP20132 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SDSP20132 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SDSP20132 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SDSP20132 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SDSP20132 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SDSP20132 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SDSP20132 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SDSP20132 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SDSP20132 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SDSP20132 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SDSP20132 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SDSP20132 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SDSP20132 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SDSP20132 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SDSP20132 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SDSP20132 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SDSP20132 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SDSP20132 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SDSP20132 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SDSP20132 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SDSP20132 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SDSP20132 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SDSP20132 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SDSP20132 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SDSP20132 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SDSP20132 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SDSP20132 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
SDSP20132 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SDSP20132 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms