Protein–RNA interactions for Protein: P18545

PDE6G, Retinal rod rhodopsin-sensitive cGMP 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit gamma, humanhuman

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Length 87 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6GP18545 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
PDE6GP18545 SATB2-211ENST00000614512 4972 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
PDE6GP18545 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
PDE6GP18545 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
PDE6GP18545 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
PDE6GP18545 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
PDE6GP18545 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
PDE6GP18545 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
PDE6GP18545 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
PDE6GP18545 AKAP13-201ENST00000361243 9468 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
PDE6GP18545 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
PDE6GP18545 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
PDE6GP18545 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
PDE6GP18545 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
PDE6GP18545 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
PDE6GP18545 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
PDE6GP18545 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
PDE6GP18545 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
PDE6GP18545 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
PDE6GP18545 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
PDE6GP18545 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
PDE6GP18545 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
PDE6GP18545 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
PDE6GP18545 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
PDE6GP18545 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
PDE6GP18545 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC10.19□□□□□ -0.78
PDE6GP18545 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.19□□□□□ -0.78
PDE6GP18545 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
PDE6GP18545 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
PDE6GP18545 TMX4-201ENST00000246024 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
PDE6GP18545 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
PDE6GP18545 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
PDE6GP18545 MBD6-201ENST00000355673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
PDE6GP18545 TRPA1-201ENST00000262209 5223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
PDE6GP18545 CFAP74-209ENST00000493964 5247 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
PDE6GP18545 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
PDE6GP18545 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
PDE6GP18545 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
PDE6GP18545 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
PDE6GP18545 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
PDE6GP18545 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
PDE6GP18545 TICRR-201ENST00000268138 6775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
PDE6GP18545 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
PDE6GP18545 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
PDE6GP18545 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
PDE6GP18545 PTPRS-204ENST00000587303 6353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
PDE6GP18545 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
PDE6GP18545 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
PDE6GP18545 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
PDE6GP18545 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
PDE6GP18545 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
PDE6GP18545 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
PDE6GP18545 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
PDE6GP18545 EDEM3-202ENST00000367512 6678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
PDE6GP18545 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
PDE6GP18545 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC10.18□□□□□ -0.78
PDE6GP18545 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
PDE6GP18545 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
PDE6GP18545 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
PDE6GP18545 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
PDE6GP18545 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
PDE6GP18545 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
PDE6GP18545 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
PDE6GP18545 CRTC1-202ENST00000338797 6929 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
PDE6GP18545 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
PDE6GP18545 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
PDE6GP18545 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
PDE6GP18545 CTIF-202ENST00000382998 4407 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
PDE6GP18545 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
PDE6GP18545 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
PDE6GP18545 YTHDF3-209ENST00000617200 5076 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
PDE6GP18545 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
PDE6GP18545 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
PDE6GP18545 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
PDE6GP18545 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
PDE6GP18545 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
PDE6GP18545 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
PDE6GP18545 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
PDE6GP18545 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
PDE6GP18545 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
PDE6GP18545 RIMBP2-201ENST00000261655 6321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
PDE6GP18545 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
PDE6GP18545 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
PDE6GP18545 CDH3-201ENST00000264012 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
PDE6GP18545 ZNF536-201ENST00000355537 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
PDE6GP18545 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
PDE6GP18545 SMC4-202ENST00000357388 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
PDE6GP18545 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
PDE6GP18545 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
PDE6GP18545 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
PDE6GP18545 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
PDE6GP18545 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
PDE6GP18545 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
PDE6GP18545 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
PDE6GP18545 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
PDE6GP18545 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
PDE6GP18545 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
PDE6GP18545 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
PDE6GP18545 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
PDE6GP18545 WASHC2C-201ENST00000336378 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
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