Protein–RNA interactions for Protein: P13612

ITGA4, Integrin alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA4P13612 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
ITGA4P13612 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ITGA4P13612 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
ITGA4P13612 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ITGA4P13612 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ITGA4P13612 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ITGA4P13612 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ITGA4P13612 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ITGA4P13612 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ITGA4P13612 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ITGA4P13612 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ITGA4P13612 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ITGA4P13612 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ITGA4P13612 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ITGA4P13612 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ITGA4P13612 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ITGA4P13612 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ITGA4P13612 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ITGA4P13612 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ITGA4P13612 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ITGA4P13612 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ITGA4P13612 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ITGA4P13612 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ITGA4P13612 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ITGA4P13612 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ITGA4P13612 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ITGA4P13612 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ITGA4P13612 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ITGA4P13612 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ITGA4P13612 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ITGA4P13612 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ITGA4P13612 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ITGA4P13612 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ITGA4P13612 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ITGA4P13612 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ITGA4P13612 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ITGA4P13612 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ITGA4P13612 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ITGA4P13612 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ITGA4P13612 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ITGA4P13612 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
ITGA4P13612 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ITGA4P13612 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
ITGA4P13612 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ITGA4P13612 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ITGA4P13612 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ITGA4P13612 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ITGA4P13612 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ITGA4P13612 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ITGA4P13612 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ITGA4P13612 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ITGA4P13612 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ITGA4P13612 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ITGA4P13612 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ITGA4P13612 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ITGA4P13612 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ITGA4P13612 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
ITGA4P13612 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ITGA4P13612 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
ITGA4P13612 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
ITGA4P13612 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ITGA4P13612 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
ITGA4P13612 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ITGA4P13612 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ITGA4P13612 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ITGA4P13612 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ITGA4P13612 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ITGA4P13612 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ITGA4P13612 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ITGA4P13612 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ITGA4P13612 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ITGA4P13612 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ITGA4P13612 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ITGA4P13612 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ITGA4P13612 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ITGA4P13612 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ITGA4P13612 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ITGA4P13612 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ITGA4P13612 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ITGA4P13612 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ITGA4P13612 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ITGA4P13612 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ITGA4P13612 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ITGA4P13612 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ITGA4P13612 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ITGA4P13612 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ITGA4P13612 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ITGA4P13612 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ITGA4P13612 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ITGA4P13612 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ITGA4P13612 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ITGA4P13612 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ITGA4P13612 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ITGA4P13612 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ITGA4P13612 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ITGA4P13612 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ITGA4P13612 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ITGA4P13612 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ITGA4P13612 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ITGA4P13612 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms