Protein–RNA interactions for Protein: P12838

DEFA4, Neutrophil defensin 4, humanhuman

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA4P12838 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
DEFA4P12838 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
DEFA4P12838 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
DEFA4P12838 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
DEFA4P12838 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
DEFA4P12838 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
DEFA4P12838 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
DEFA4P12838 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
DEFA4P12838 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
DEFA4P12838 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
DEFA4P12838 PRKY-203ENST00000528056 7218 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
DEFA4P12838 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
DEFA4P12838 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
DEFA4P12838 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
DEFA4P12838 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
DEFA4P12838 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
DEFA4P12838 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
DEFA4P12838 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
DEFA4P12838 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
DEFA4P12838 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
DEFA4P12838 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
DEFA4P12838 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
DEFA4P12838 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
DEFA4P12838 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
DEFA4P12838 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
DEFA4P12838 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
DEFA4P12838 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
DEFA4P12838 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
DEFA4P12838 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
DEFA4P12838 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
DEFA4P12838 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
DEFA4P12838 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
DEFA4P12838 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
DEFA4P12838 ELP1-201ENST00000374647 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
DEFA4P12838 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
DEFA4P12838 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
DEFA4P12838 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
DEFA4P12838 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
DEFA4P12838 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
DEFA4P12838 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
DEFA4P12838 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
DEFA4P12838 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
DEFA4P12838 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
DEFA4P12838 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
DEFA4P12838 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
DEFA4P12838 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
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DEFA4P12838 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
DEFA4P12838 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
DEFA4P12838 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
DEFA4P12838 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
DEFA4P12838 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
DEFA4P12838 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
DEFA4P12838 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
DEFA4P12838 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
DEFA4P12838 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
DEFA4P12838 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
DEFA4P12838 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
DEFA4P12838 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
DEFA4P12838 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
DEFA4P12838 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
DEFA4P12838 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
DEFA4P12838 IL17RA-201ENST00000319363 8607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
DEFA4P12838 NOP9-201ENST00000267425 6033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
DEFA4P12838 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
DEFA4P12838 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
DEFA4P12838 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
DEFA4P12838 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
DEFA4P12838 TCHH-201ENST00000368804 6900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
DEFA4P12838 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
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DEFA4P12838 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
DEFA4P12838 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
DEFA4P12838 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
DEFA4P12838 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
DEFA4P12838 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
DEFA4P12838 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
DEFA4P12838 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
DEFA4P12838 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
DEFA4P12838 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
DEFA4P12838 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
DEFA4P12838 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
DEFA4P12838 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
DEFA4P12838 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
DEFA4P12838 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
DEFA4P12838 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
DEFA4P12838 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
DEFA4P12838 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
DEFA4P12838 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
DEFA4P12838 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
DEFA4P12838 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
DEFA4P12838 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
DEFA4P12838 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
DEFA4P12838 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC13.44□□□□□ -0.26
DEFA4P12838 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
DEFA4P12838 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
DEFA4P12838 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
DEFA4P12838 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
DEFA4P12838 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
DEFA4P12838 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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