Protein–RNA interactions for Protein: P11230

CHRNB1, Acetylcholine receptor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB1P11230 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CHRNB1P11230 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CHRNB1P11230 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CHRNB1P11230 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CHRNB1P11230 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CHRNB1P11230 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CHRNB1P11230 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CHRNB1P11230 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CHRNB1P11230 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CHRNB1P11230 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CHRNB1P11230 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CHRNB1P11230 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CHRNB1P11230 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CHRNB1P11230 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CHRNB1P11230 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CHRNB1P11230 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CHRNB1P11230 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CHRNB1P11230 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CHRNB1P11230 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CHRNB1P11230 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CHRNB1P11230 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CHRNB1P11230 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CHRNB1P11230 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CHRNB1P11230 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CHRNB1P11230 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CHRNB1P11230 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CHRNB1P11230 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CHRNB1P11230 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CHRNB1P11230 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CHRNB1P11230 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CHRNB1P11230 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CHRNB1P11230 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CHRNB1P11230 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CHRNB1P11230 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CHRNB1P11230 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CHRNB1P11230 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CHRNB1P11230 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CHRNB1P11230 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CHRNB1P11230 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CHRNB1P11230 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CHRNB1P11230 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CHRNB1P11230 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CHRNB1P11230 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CHRNB1P11230 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CHRNB1P11230 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CHRNB1P11230 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CHRNB1P11230 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CHRNB1P11230 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CHRNB1P11230 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CHRNB1P11230 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CHRNB1P11230 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CHRNB1P11230 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CHRNB1P11230 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CHRNB1P11230 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CHRNB1P11230 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CHRNB1P11230 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CHRNB1P11230 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CHRNB1P11230 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CHRNB1P11230 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CHRNB1P11230 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CHRNB1P11230 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CHRNB1P11230 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CHRNB1P11230 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CHRNB1P11230 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CHRNB1P11230 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CHRNB1P11230 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CHRNB1P11230 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CHRNB1P11230 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CHRNB1P11230 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CHRNB1P11230 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CHRNB1P11230 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CHRNB1P11230 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CHRNB1P11230 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CHRNB1P11230 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CHRNB1P11230 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CHRNB1P11230 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CHRNB1P11230 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CHRNB1P11230 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CHRNB1P11230 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CHRNB1P11230 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CHRNB1P11230 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CHRNB1P11230 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CHRNB1P11230 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CHRNB1P11230 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CHRNB1P11230 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CHRNB1P11230 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CHRNB1P11230 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CHRNB1P11230 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CHRNB1P11230 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CHRNB1P11230 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CHRNB1P11230 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CHRNB1P11230 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CHRNB1P11230 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CHRNB1P11230 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CHRNB1P11230 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CHRNB1P11230 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CHRNB1P11230 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CHRNB1P11230 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CHRNB1P11230 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CHRNB1P11230 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.5 ms