Protein–RNA interactions for Protein: O95352

ATG7, Ubiquitin-like modifier-activating enzyme ATG7, humanhuman

Predictions only

Length 703 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG7O95352 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
ATG7O95352 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATG7O95352 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATG7O95352 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATG7O95352 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATG7O95352 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
ATG7O95352 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATG7O95352 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATG7O95352 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATG7O95352 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATG7O95352 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATG7O95352 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATG7O95352 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATG7O95352 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATG7O95352 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATG7O95352 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATG7O95352 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATG7O95352 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATG7O95352 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATG7O95352 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATG7O95352 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATG7O95352 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATG7O95352 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATG7O95352 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATG7O95352 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATG7O95352 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATG7O95352 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATG7O95352 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATG7O95352 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATG7O95352 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATG7O95352 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATG7O95352 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
ATG7O95352 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATG7O95352 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATG7O95352 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
ATG7O95352 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATG7O95352 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATG7O95352 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATG7O95352 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATG7O95352 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATG7O95352 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATG7O95352 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATG7O95352 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
ATG7O95352 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
ATG7O95352 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATG7O95352 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATG7O95352 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATG7O95352 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATG7O95352 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATG7O95352 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATG7O95352 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATG7O95352 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATG7O95352 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATG7O95352 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATG7O95352 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATG7O95352 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATG7O95352 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
ATG7O95352 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATG7O95352 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATG7O95352 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATG7O95352 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATG7O95352 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATG7O95352 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATG7O95352 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATG7O95352 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATG7O95352 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
ATG7O95352 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATG7O95352 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATG7O95352 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
ATG7O95352 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATG7O95352 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
ATG7O95352 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATG7O95352 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATG7O95352 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATG7O95352 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATG7O95352 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATG7O95352 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATG7O95352 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATG7O95352 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATG7O95352 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATG7O95352 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
ATG7O95352 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATG7O95352 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATG7O95352 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATG7O95352 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATG7O95352 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATG7O95352 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATG7O95352 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATG7O95352 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATG7O95352 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATG7O95352 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATG7O95352 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATG7O95352 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATG7O95352 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
ATG7O95352 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATG7O95352 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATG7O95352 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATG7O95352 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
ATG7O95352 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATG7O95352 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms