Protein–RNA interactions for Protein: O75563

SKAP2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP2O75563 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SKAP2O75563 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SKAP2O75563 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SKAP2O75563 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SKAP2O75563 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SKAP2O75563 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SKAP2O75563 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SKAP2O75563 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SKAP2O75563 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SKAP2O75563 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SKAP2O75563 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SKAP2O75563 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SKAP2O75563 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SKAP2O75563 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SKAP2O75563 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SKAP2O75563 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SKAP2O75563 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SKAP2O75563 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SKAP2O75563 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SKAP2O75563 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SKAP2O75563 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SKAP2O75563 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SKAP2O75563 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SKAP2O75563 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SKAP2O75563 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SKAP2O75563 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SKAP2O75563 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SKAP2O75563 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SKAP2O75563 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SKAP2O75563 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SKAP2O75563 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SKAP2O75563 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SKAP2O75563 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SKAP2O75563 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SKAP2O75563 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SKAP2O75563 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SKAP2O75563 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SKAP2O75563 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SKAP2O75563 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SKAP2O75563 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SKAP2O75563 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SKAP2O75563 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SKAP2O75563 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SKAP2O75563 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SKAP2O75563 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SKAP2O75563 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SKAP2O75563 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SKAP2O75563 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SKAP2O75563 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SKAP2O75563 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SKAP2O75563 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SKAP2O75563 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SKAP2O75563 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SKAP2O75563 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SKAP2O75563 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SKAP2O75563 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SKAP2O75563 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SKAP2O75563 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SKAP2O75563 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SKAP2O75563 AL137784.3-201ENST00000623858 2288 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SKAP2O75563 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SKAP2O75563 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SKAP2O75563 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SKAP2O75563 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SKAP2O75563 ARMC5-205ENST00000563544 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SKAP2O75563 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SKAP2O75563 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SKAP2O75563 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SKAP2O75563 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SKAP2O75563 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SKAP2O75563 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SKAP2O75563 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SKAP2O75563 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SKAP2O75563 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SKAP2O75563 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SKAP2O75563 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SKAP2O75563 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SKAP2O75563 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SKAP2O75563 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SKAP2O75563 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SKAP2O75563 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SKAP2O75563 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SKAP2O75563 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SKAP2O75563 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SKAP2O75563 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SKAP2O75563 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SKAP2O75563 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SKAP2O75563 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SKAP2O75563 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SKAP2O75563 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SKAP2O75563 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SKAP2O75563 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SKAP2O75563 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SKAP2O75563 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SKAP2O75563 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SKAP2O75563 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SKAP2O75563 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SKAP2O75563 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SKAP2O75563 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SKAP2O75563 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms