Protein–RNA interactions for Protein: O43900

PRICKLE3, Prickle planar cell polarity protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRICKLE3O43900 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRICKLE3O43900 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRICKLE3O43900 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRICKLE3O43900 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRICKLE3O43900 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRICKLE3O43900 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRICKLE3O43900 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRICKLE3O43900 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRICKLE3O43900 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PRICKLE3O43900 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRICKLE3O43900 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRICKLE3O43900 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRICKLE3O43900 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRICKLE3O43900 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRICKLE3O43900 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRICKLE3O43900 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRICKLE3O43900 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRICKLE3O43900 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRICKLE3O43900 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRICKLE3O43900 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRICKLE3O43900 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRICKLE3O43900 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PRICKLE3O43900 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRICKLE3O43900 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRICKLE3O43900 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRICKLE3O43900 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRICKLE3O43900 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRICKLE3O43900 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRICKLE3O43900 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRICKLE3O43900 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRICKLE3O43900 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRICKLE3O43900 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRICKLE3O43900 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRICKLE3O43900 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRICKLE3O43900 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRICKLE3O43900 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PRICKLE3O43900 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRICKLE3O43900 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRICKLE3O43900 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRICKLE3O43900 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRICKLE3O43900 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRICKLE3O43900 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRICKLE3O43900 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRICKLE3O43900 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRICKLE3O43900 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRICKLE3O43900 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRICKLE3O43900 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRICKLE3O43900 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRICKLE3O43900 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRICKLE3O43900 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRICKLE3O43900 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PRICKLE3O43900 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRICKLE3O43900 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRICKLE3O43900 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PRICKLE3O43900 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRICKLE3O43900 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PRICKLE3O43900 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRICKLE3O43900 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRICKLE3O43900 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRICKLE3O43900 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRICKLE3O43900 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRICKLE3O43900 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRICKLE3O43900 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRICKLE3O43900 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRICKLE3O43900 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRICKLE3O43900 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRICKLE3O43900 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRICKLE3O43900 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRICKLE3O43900 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRICKLE3O43900 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRICKLE3O43900 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRICKLE3O43900 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRICKLE3O43900 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRICKLE3O43900 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRICKLE3O43900 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRICKLE3O43900 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRICKLE3O43900 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRICKLE3O43900 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRICKLE3O43900 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRICKLE3O43900 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRICKLE3O43900 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRICKLE3O43900 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRICKLE3O43900 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRICKLE3O43900 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRICKLE3O43900 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRICKLE3O43900 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRICKLE3O43900 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRICKLE3O43900 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRICKLE3O43900 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRICKLE3O43900 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRICKLE3O43900 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRICKLE3O43900 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRICKLE3O43900 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRICKLE3O43900 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRICKLE3O43900 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRICKLE3O43900 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRICKLE3O43900 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRICKLE3O43900 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRICKLE3O43900 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRICKLE3O43900 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms