Protein–RNA interactions for Protein: J3KSC0

LINC01387, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01387, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01387J3KSC0 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LINC01387J3KSC0 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LINC01387J3KSC0 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
LINC01387J3KSC0 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
LINC01387J3KSC0 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
LINC01387J3KSC0 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
LINC01387J3KSC0 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
LINC01387J3KSC0 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC14.92□□□□□ -0.02
LINC01387J3KSC0 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
LINC01387J3KSC0 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
LINC01387J3KSC0 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
LINC01387J3KSC0 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC14.92□□□□□ -0.02
LINC01387J3KSC0 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
LINC01387J3KSC0 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
LINC01387J3KSC0 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
LINC01387J3KSC0 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
LINC01387J3KSC0 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LINC01387J3KSC0 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LINC01387J3KSC0 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LINC01387J3KSC0 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
LINC01387J3KSC0 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
LINC01387J3KSC0 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
LINC01387J3KSC0 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LINC01387J3KSC0 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
LINC01387J3KSC0 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LINC01387J3KSC0 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LINC01387J3KSC0 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LINC01387J3KSC0 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LINC01387J3KSC0 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LINC01387J3KSC0 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
LINC01387J3KSC0 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
LINC01387J3KSC0 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
LINC01387J3KSC0 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
LINC01387J3KSC0 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
LINC01387J3KSC0 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
LINC01387J3KSC0 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
LINC01387J3KSC0 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
LINC01387J3KSC0 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
LINC01387J3KSC0 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
LINC01387J3KSC0 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
LINC01387J3KSC0 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
LINC01387J3KSC0 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
LINC01387J3KSC0 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
LINC01387J3KSC0 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
LINC01387J3KSC0 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
LINC01387J3KSC0 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
LINC01387J3KSC0 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
LINC01387J3KSC0 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
LINC01387J3KSC0 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
LINC01387J3KSC0 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
LINC01387J3KSC0 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
LINC01387J3KSC0 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
LINC01387J3KSC0 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
LINC01387J3KSC0 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
LINC01387J3KSC0 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
LINC01387J3KSC0 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
LINC01387J3KSC0 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC14.91□□□□□ -0.02
LINC01387J3KSC0 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
LINC01387J3KSC0 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
LINC01387J3KSC0 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
LINC01387J3KSC0 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
LINC01387J3KSC0 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
LINC01387J3KSC0 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC14.91□□□□□ -0.02
LINC01387J3KSC0 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
LINC01387J3KSC0 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
LINC01387J3KSC0 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
LINC01387J3KSC0 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
LINC01387J3KSC0 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
LINC01387J3KSC0 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
LINC01387J3KSC0 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
LINC01387J3KSC0 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
LINC01387J3KSC0 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
LINC01387J3KSC0 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
LINC01387J3KSC0 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
LINC01387J3KSC0 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
LINC01387J3KSC0 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
LINC01387J3KSC0 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
LINC01387J3KSC0 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
LINC01387J3KSC0 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
LINC01387J3KSC0 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
LINC01387J3KSC0 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
LINC01387J3KSC0 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
LINC01387J3KSC0 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
LINC01387J3KSC0 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
LINC01387J3KSC0 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
LINC01387J3KSC0 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
LINC01387J3KSC0 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
LINC01387J3KSC0 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
LINC01387J3KSC0 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
LINC01387J3KSC0 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
LINC01387J3KSC0 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
LINC01387J3KSC0 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
LINC01387J3KSC0 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
LINC01387J3KSC0 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
LINC01387J3KSC0 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
LINC01387J3KSC0 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
LINC01387J3KSC0 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
LINC01387J3KSC0 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
LINC01387J3KSC0 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
LINC01387J3KSC0 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms