Protein–RNA interactions for Protein: H3BPF8

GOLGA8S, Golgin A8 family member S, humanhuman

Predictions only

Length 625 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA8SH3BPF8 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GOLGA8SH3BPF8 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GOLGA8SH3BPF8 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GOLGA8SH3BPF8 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GOLGA8SH3BPF8 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GOLGA8SH3BPF8 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GOLGA8SH3BPF8 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GOLGA8SH3BPF8 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GOLGA8SH3BPF8 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GOLGA8SH3BPF8 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GOLGA8SH3BPF8 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GOLGA8SH3BPF8 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GOLGA8SH3BPF8 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GOLGA8SH3BPF8 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GOLGA8SH3BPF8 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GOLGA8SH3BPF8 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GOLGA8SH3BPF8 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GOLGA8SH3BPF8 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GOLGA8SH3BPF8 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GOLGA8SH3BPF8 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GOLGA8SH3BPF8 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GOLGA8SH3BPF8 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GOLGA8SH3BPF8 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GOLGA8SH3BPF8 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GOLGA8SH3BPF8 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GOLGA8SH3BPF8 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GOLGA8SH3BPF8 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GOLGA8SH3BPF8 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GOLGA8SH3BPF8 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GOLGA8SH3BPF8 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GOLGA8SH3BPF8 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GOLGA8SH3BPF8 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GOLGA8SH3BPF8 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GOLGA8SH3BPF8 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GOLGA8SH3BPF8 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GOLGA8SH3BPF8 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
GOLGA8SH3BPF8 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GOLGA8SH3BPF8 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
GOLGA8SH3BPF8 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GOLGA8SH3BPF8 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GOLGA8SH3BPF8 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GOLGA8SH3BPF8 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GOLGA8SH3BPF8 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GOLGA8SH3BPF8 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
GOLGA8SH3BPF8 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GOLGA8SH3BPF8 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GOLGA8SH3BPF8 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
GOLGA8SH3BPF8 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GOLGA8SH3BPF8 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GOLGA8SH3BPF8 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
GOLGA8SH3BPF8 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GOLGA8SH3BPF8 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GOLGA8SH3BPF8 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GOLGA8SH3BPF8 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GOLGA8SH3BPF8 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GOLGA8SH3BPF8 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GOLGA8SH3BPF8 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GOLGA8SH3BPF8 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GOLGA8SH3BPF8 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GOLGA8SH3BPF8 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GOLGA8SH3BPF8 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GOLGA8SH3BPF8 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GOLGA8SH3BPF8 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GOLGA8SH3BPF8 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GOLGA8SH3BPF8 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GOLGA8SH3BPF8 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GOLGA8SH3BPF8 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GOLGA8SH3BPF8 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GOLGA8SH3BPF8 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GOLGA8SH3BPF8 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GOLGA8SH3BPF8 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GOLGA8SH3BPF8 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GOLGA8SH3BPF8 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GOLGA8SH3BPF8 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GOLGA8SH3BPF8 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GOLGA8SH3BPF8 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
GOLGA8SH3BPF8 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GOLGA8SH3BPF8 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
GOLGA8SH3BPF8 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GOLGA8SH3BPF8 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GOLGA8SH3BPF8 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GOLGA8SH3BPF8 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GOLGA8SH3BPF8 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GOLGA8SH3BPF8 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GOLGA8SH3BPF8 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GOLGA8SH3BPF8 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GOLGA8SH3BPF8 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GOLGA8SH3BPF8 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GOLGA8SH3BPF8 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GOLGA8SH3BPF8 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GOLGA8SH3BPF8 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GOLGA8SH3BPF8 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GOLGA8SH3BPF8 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GOLGA8SH3BPF8 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GOLGA8SH3BPF8 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GOLGA8SH3BPF8 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GOLGA8SH3BPF8 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GOLGA8SH3BPF8 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GOLGA8SH3BPF8 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
GOLGA8SH3BPF8 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.8 ms